Protein–RNA interactions for Protein: P12107

COL11A1, Collagen alpha-1(XI) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL11A1P12107 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
COL11A1P12107 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
COL11A1P12107 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
COL11A1P12107 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
COL11A1P12107 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
COL11A1P12107 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
COL11A1P12107 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
COL11A1P12107 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
COL11A1P12107 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
COL11A1P12107 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
COL11A1P12107 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
COL11A1P12107 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
COL11A1P12107 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
COL11A1P12107 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
COL11A1P12107 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
COL11A1P12107 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
COL11A1P12107 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
COL11A1P12107 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
COL11A1P12107 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
COL11A1P12107 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
COL11A1P12107 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
COL11A1P12107 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
COL11A1P12107 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
COL11A1P12107 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
COL11A1P12107 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
COL11A1P12107 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
COL11A1P12107 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
COL11A1P12107 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
COL11A1P12107 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
COL11A1P12107 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
COL11A1P12107 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
COL11A1P12107 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
COL11A1P12107 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
COL11A1P12107 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
COL11A1P12107 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
COL11A1P12107 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
COL11A1P12107 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
COL11A1P12107 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
COL11A1P12107 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
COL11A1P12107 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
COL11A1P12107 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
COL11A1P12107 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
COL11A1P12107 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
COL11A1P12107 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
COL11A1P12107 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
COL11A1P12107 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
COL11A1P12107 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
COL11A1P12107 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
COL11A1P12107 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
COL11A1P12107 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
COL11A1P12107 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
COL11A1P12107 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
COL11A1P12107 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
COL11A1P12107 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
COL11A1P12107 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
COL11A1P12107 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
COL11A1P12107 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
COL11A1P12107 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
COL11A1P12107 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
COL11A1P12107 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
COL11A1P12107 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
COL11A1P12107 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
COL11A1P12107 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
COL11A1P12107 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
COL11A1P12107 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
COL11A1P12107 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
COL11A1P12107 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
COL11A1P12107 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
COL11A1P12107 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
COL11A1P12107 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
COL11A1P12107 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
COL11A1P12107 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
COL11A1P12107 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
COL11A1P12107 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
COL11A1P12107 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
COL11A1P12107 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
COL11A1P12107 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
COL11A1P12107 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
COL11A1P12107 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
COL11A1P12107 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
COL11A1P12107 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
COL11A1P12107 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
COL11A1P12107 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
COL11A1P12107 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
COL11A1P12107 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
COL11A1P12107 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
COL11A1P12107 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
COL11A1P12107 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
COL11A1P12107 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
COL11A1P12107 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
COL11A1P12107 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
COL11A1P12107 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
COL11A1P12107 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC26.66■■□□□ 1.86
COL11A1P12107 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
COL11A1P12107 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
COL11A1P12107 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
COL11A1P12107 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
COL11A1P12107 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
COL11A1P12107 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
COL11A1P12107 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms