Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
VPREB1P12018 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
VPREB1P12018 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
VPREB1P12018 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
VPREB1P12018 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
VPREB1P12018 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
VPREB1P12018 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
VPREB1P12018 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
VPREB1P12018 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
VPREB1P12018 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
VPREB1P12018 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
VPREB1P12018 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
VPREB1P12018 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
VPREB1P12018 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
VPREB1P12018 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
VPREB1P12018 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
VPREB1P12018 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
VPREB1P12018 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
VPREB1P12018 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
VPREB1P12018 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
VPREB1P12018 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
VPREB1P12018 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
VPREB1P12018 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
VPREB1P12018 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
VPREB1P12018 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
VPREB1P12018 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
VPREB1P12018 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
VPREB1P12018 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
VPREB1P12018 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
VPREB1P12018 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
VPREB1P12018 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
VPREB1P12018 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
VPREB1P12018 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
VPREB1P12018 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
VPREB1P12018 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
VPREB1P12018 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
VPREB1P12018 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
VPREB1P12018 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
VPREB1P12018 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
VPREB1P12018 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
VPREB1P12018 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
VPREB1P12018 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
VPREB1P12018 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
VPREB1P12018 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
VPREB1P12018 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
VPREB1P12018 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
VPREB1P12018 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
VPREB1P12018 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
VPREB1P12018 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
VPREB1P12018 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
VPREB1P12018 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
VPREB1P12018 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
VPREB1P12018 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
VPREB1P12018 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
VPREB1P12018 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
VPREB1P12018 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
VPREB1P12018 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
VPREB1P12018 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
VPREB1P12018 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
VPREB1P12018 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
VPREB1P12018 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
VPREB1P12018 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
VPREB1P12018 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
VPREB1P12018 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
VPREB1P12018 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
VPREB1P12018 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
VPREB1P12018 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
VPREB1P12018 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
VPREB1P12018 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
VPREB1P12018 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
VPREB1P12018 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
VPREB1P12018 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
VPREB1P12018 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
VPREB1P12018 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
VPREB1P12018 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
VPREB1P12018 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
VPREB1P12018 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
VPREB1P12018 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
VPREB1P12018 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
VPREB1P12018 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
VPREB1P12018 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
VPREB1P12018 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
VPREB1P12018 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
VPREB1P12018 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
VPREB1P12018 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
VPREB1P12018 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
VPREB1P12018 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
VPREB1P12018 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
VPREB1P12018 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
VPREB1P12018 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
VPREB1P12018 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
VPREB1P12018 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
VPREB1P12018 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
VPREB1P12018 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
VPREB1P12018 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
VPREB1P12018 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
VPREB1P12018 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
VPREB1P12018 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
VPREB1P12018 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
VPREB1P12018 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms