Protein–RNA interactions for Protein: P11230

CHRNB1, Acetylcholine receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB1P11230 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHRNB1P11230 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHRNB1P11230 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHRNB1P11230 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHRNB1P11230 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHRNB1P11230 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CHRNB1P11230 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHRNB1P11230 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHRNB1P11230 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHRNB1P11230 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHRNB1P11230 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHRNB1P11230 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHRNB1P11230 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHRNB1P11230 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHRNB1P11230 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHRNB1P11230 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CHRNB1P11230 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CHRNB1P11230 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHRNB1P11230 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHRNB1P11230 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHRNB1P11230 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHRNB1P11230 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHRNB1P11230 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHRNB1P11230 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHRNB1P11230 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHRNB1P11230 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHRNB1P11230 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHRNB1P11230 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHRNB1P11230 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CHRNB1P11230 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CHRNB1P11230 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHRNB1P11230 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHRNB1P11230 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHRNB1P11230 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHRNB1P11230 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CHRNB1P11230 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CHRNB1P11230 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CHRNB1P11230 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CHRNB1P11230 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CHRNB1P11230 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHRNB1P11230 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHRNB1P11230 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHRNB1P11230 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHRNB1P11230 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHRNB1P11230 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHRNB1P11230 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CHRNB1P11230 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHRNB1P11230 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHRNB1P11230 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CHRNB1P11230 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHRNB1P11230 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHRNB1P11230 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHRNB1P11230 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHRNB1P11230 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHRNB1P11230 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHRNB1P11230 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHRNB1P11230 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHRNB1P11230 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHRNB1P11230 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHRNB1P11230 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHRNB1P11230 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHRNB1P11230 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHRNB1P11230 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHRNB1P11230 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHRNB1P11230 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHRNB1P11230 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CHRNB1P11230 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHRNB1P11230 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHRNB1P11230 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHRNB1P11230 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHRNB1P11230 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHRNB1P11230 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHRNB1P11230 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CHRNB1P11230 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHRNB1P11230 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHRNB1P11230 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CHRNB1P11230 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CHRNB1P11230 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CHRNB1P11230 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CHRNB1P11230 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CHRNB1P11230 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CHRNB1P11230 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CHRNB1P11230 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CHRNB1P11230 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CHRNB1P11230 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHRNB1P11230 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHRNB1P11230 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHRNB1P11230 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHRNB1P11230 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHRNB1P11230 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHRNB1P11230 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHRNB1P11230 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHRNB1P11230 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHRNB1P11230 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CHRNB1P11230 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHRNB1P11230 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHRNB1P11230 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHRNB1P11230 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHRNB1P11230 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CHRNB1P11230 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.9 ms