Protein–RNA interactions for Protein: P10747

CD28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD28P10747 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CD28P10747 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CD28P10747 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CD28P10747 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CD28P10747 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CD28P10747 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CD28P10747 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CD28P10747 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CD28P10747 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CD28P10747 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CD28P10747 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CD28P10747 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CD28P10747 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CD28P10747 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CD28P10747 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CD28P10747 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CD28P10747 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CD28P10747 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CD28P10747 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CD28P10747 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CD28P10747 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CD28P10747 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CD28P10747 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CD28P10747 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CD28P10747 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CD28P10747 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CD28P10747 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CD28P10747 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CD28P10747 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CD28P10747 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CD28P10747 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CD28P10747 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CD28P10747 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CD28P10747 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CD28P10747 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CD28P10747 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CD28P10747 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CD28P10747 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CD28P10747 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CD28P10747 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CD28P10747 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CD28P10747 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CD28P10747 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CD28P10747 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CD28P10747 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CD28P10747 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CD28P10747 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CD28P10747 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CD28P10747 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CD28P10747 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CD28P10747 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CD28P10747 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CD28P10747 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CD28P10747 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CD28P10747 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CD28P10747 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CD28P10747 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CD28P10747 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CD28P10747 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CD28P10747 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CD28P10747 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CD28P10747 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CD28P10747 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CD28P10747 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CD28P10747 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CD28P10747 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CD28P10747 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CD28P10747 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CD28P10747 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CD28P10747 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CD28P10747 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CD28P10747 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CD28P10747 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CD28P10747 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CD28P10747 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CD28P10747 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CD28P10747 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CD28P10747 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CD28P10747 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CD28P10747 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CD28P10747 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CD28P10747 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CD28P10747 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CD28P10747 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CD28P10747 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CD28P10747 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CD28P10747 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CD28P10747 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CD28P10747 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CD28P10747 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CD28P10747 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CD28P10747 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CD28P10747 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CD28P10747 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CD28P10747 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CD28P10747 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CD28P10747 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CD28P10747 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CD28P10747 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CD28P10747 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms