Protein–RNA interactions for Protein: P10745

RBP3, Retinol-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBP3P10745 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RBP3P10745 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RBP3P10745 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RBP3P10745 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
RBP3P10745 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RBP3P10745 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RBP3P10745 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
RBP3P10745 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RBP3P10745 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RBP3P10745 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RBP3P10745 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RBP3P10745 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RBP3P10745 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RBP3P10745 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
RBP3P10745 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RBP3P10745 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RBP3P10745 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
RBP3P10745 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RBP3P10745 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RBP3P10745 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RBP3P10745 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RBP3P10745 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RBP3P10745 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RBP3P10745 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RBP3P10745 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RBP3P10745 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RBP3P10745 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RBP3P10745 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RBP3P10745 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RBP3P10745 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RBP3P10745 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RBP3P10745 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RBP3P10745 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RBP3P10745 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RBP3P10745 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RBP3P10745 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RBP3P10745 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RBP3P10745 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RBP3P10745 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RBP3P10745 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RBP3P10745 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RBP3P10745 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RBP3P10745 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
RBP3P10745 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RBP3P10745 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RBP3P10745 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RBP3P10745 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RBP3P10745 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RBP3P10745 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RBP3P10745 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RBP3P10745 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RBP3P10745 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RBP3P10745 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
RBP3P10745 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RBP3P10745 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RBP3P10745 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RBP3P10745 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RBP3P10745 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RBP3P10745 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
RBP3P10745 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
RBP3P10745 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
RBP3P10745 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RBP3P10745 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RBP3P10745 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RBP3P10745 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RBP3P10745 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RBP3P10745 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RBP3P10745 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RBP3P10745 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RBP3P10745 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RBP3P10745 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RBP3P10745 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RBP3P10745 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RBP3P10745 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RBP3P10745 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RBP3P10745 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RBP3P10745 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RBP3P10745 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RBP3P10745 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RBP3P10745 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RBP3P10745 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RBP3P10745 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RBP3P10745 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RBP3P10745 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RBP3P10745 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RBP3P10745 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RBP3P10745 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RBP3P10745 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RBP3P10745 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
RBP3P10745 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RBP3P10745 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RBP3P10745 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RBP3P10745 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RBP3P10745 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RBP3P10745 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RBP3P10745 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RBP3P10745 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RBP3P10745 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RBP3P10745 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RBP3P10745 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms