Protein–RNA interactions for Protein: P10600

TGFB3, Transforming growth factor beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFB3P10600 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TGFB3P10600 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TGFB3P10600 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TGFB3P10600 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TGFB3P10600 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TGFB3P10600 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TGFB3P10600 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TGFB3P10600 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TGFB3P10600 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TGFB3P10600 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TGFB3P10600 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TGFB3P10600 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TGFB3P10600 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TGFB3P10600 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
TGFB3P10600 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TGFB3P10600 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TGFB3P10600 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TGFB3P10600 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
TGFB3P10600 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TGFB3P10600 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TGFB3P10600 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TGFB3P10600 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
TGFB3P10600 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TGFB3P10600 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
TGFB3P10600 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TGFB3P10600 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TGFB3P10600 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TGFB3P10600 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TGFB3P10600 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
TGFB3P10600 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TGFB3P10600 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TGFB3P10600 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TGFB3P10600 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
TGFB3P10600 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
TGFB3P10600 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TGFB3P10600 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TGFB3P10600 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TGFB3P10600 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TGFB3P10600 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TGFB3P10600 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TGFB3P10600 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TGFB3P10600 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TGFB3P10600 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TGFB3P10600 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TGFB3P10600 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TGFB3P10600 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TGFB3P10600 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TGFB3P10600 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TGFB3P10600 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
TGFB3P10600 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TGFB3P10600 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TGFB3P10600 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TGFB3P10600 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TGFB3P10600 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TGFB3P10600 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TGFB3P10600 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TGFB3P10600 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TGFB3P10600 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TGFB3P10600 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TGFB3P10600 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TGFB3P10600 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TGFB3P10600 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TGFB3P10600 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TGFB3P10600 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TGFB3P10600 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
TGFB3P10600 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TGFB3P10600 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TGFB3P10600 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TGFB3P10600 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TGFB3P10600 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TGFB3P10600 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TGFB3P10600 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TGFB3P10600 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TGFB3P10600 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TGFB3P10600 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TGFB3P10600 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TGFB3P10600 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TGFB3P10600 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TGFB3P10600 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TGFB3P10600 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TGFB3P10600 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TGFB3P10600 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TGFB3P10600 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TGFB3P10600 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TGFB3P10600 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TGFB3P10600 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TGFB3P10600 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TGFB3P10600 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TGFB3P10600 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TGFB3P10600 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TGFB3P10600 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TGFB3P10600 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TGFB3P10600 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TGFB3P10600 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TGFB3P10600 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TGFB3P10600 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TGFB3P10600 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
TGFB3P10600 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TGFB3P10600 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TGFB3P10600 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.4 ms