Protein–RNA interactions for Protein: P0DMB2

C8orf88, Uncharacterized protein C8orf88, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf88P0DMB2 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
C8orf88P0DMB2 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
C8orf88P0DMB2 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
C8orf88P0DMB2 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
C8orf88P0DMB2 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
C8orf88P0DMB2 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
C8orf88P0DMB2 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
C8orf88P0DMB2 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
C8orf88P0DMB2 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
C8orf88P0DMB2 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
C8orf88P0DMB2 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
C8orf88P0DMB2 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
C8orf88P0DMB2 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
C8orf88P0DMB2 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
C8orf88P0DMB2 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
C8orf88P0DMB2 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
C8orf88P0DMB2 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
C8orf88P0DMB2 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
C8orf88P0DMB2 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
C8orf88P0DMB2 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
C8orf88P0DMB2 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
C8orf88P0DMB2 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
C8orf88P0DMB2 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
C8orf88P0DMB2 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
C8orf88P0DMB2 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
C8orf88P0DMB2 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
C8orf88P0DMB2 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
C8orf88P0DMB2 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C8orf88P0DMB2 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C8orf88P0DMB2 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
C8orf88P0DMB2 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C8orf88P0DMB2 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C8orf88P0DMB2 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C8orf88P0DMB2 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C8orf88P0DMB2 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C8orf88P0DMB2 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C8orf88P0DMB2 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C8orf88P0DMB2 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C8orf88P0DMB2 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C8orf88P0DMB2 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C8orf88P0DMB2 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C8orf88P0DMB2 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C8orf88P0DMB2 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C8orf88P0DMB2 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C8orf88P0DMB2 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C8orf88P0DMB2 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C8orf88P0DMB2 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C8orf88P0DMB2 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C8orf88P0DMB2 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
C8orf88P0DMB2 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C8orf88P0DMB2 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C8orf88P0DMB2 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C8orf88P0DMB2 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C8orf88P0DMB2 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C8orf88P0DMB2 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C8orf88P0DMB2 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C8orf88P0DMB2 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C8orf88P0DMB2 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
C8orf88P0DMB2 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C8orf88P0DMB2 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C8orf88P0DMB2 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C8orf88P0DMB2 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C8orf88P0DMB2 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C8orf88P0DMB2 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C8orf88P0DMB2 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C8orf88P0DMB2 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C8orf88P0DMB2 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C8orf88P0DMB2 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C8orf88P0DMB2 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C8orf88P0DMB2 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
C8orf88P0DMB2 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C8orf88P0DMB2 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C8orf88P0DMB2 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C8orf88P0DMB2 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C8orf88P0DMB2 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C8orf88P0DMB2 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C8orf88P0DMB2 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
C8orf88P0DMB2 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C8orf88P0DMB2 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C8orf88P0DMB2 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C8orf88P0DMB2 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C8orf88P0DMB2 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C8orf88P0DMB2 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
C8orf88P0DMB2 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
C8orf88P0DMB2 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C8orf88P0DMB2 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C8orf88P0DMB2 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
C8orf88P0DMB2 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C8orf88P0DMB2 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
C8orf88P0DMB2 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C8orf88P0DMB2 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
C8orf88P0DMB2 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
C8orf88P0DMB2 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
C8orf88P0DMB2 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C8orf88P0DMB2 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
C8orf88P0DMB2 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
C8orf88P0DMB2 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
C8orf88P0DMB2 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C8orf88P0DMB2 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C8orf88P0DMB2 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms