Protein–RNA interactions for Protein: P0C221

CCDC175, Coiled-coil domain-containing protein 175, humanhuman

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC175P0C221 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC175P0C221 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC175P0C221 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC175P0C221 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC175P0C221 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC175P0C221 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC175P0C221 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC175P0C221 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC175P0C221 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC175P0C221 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC175P0C221 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC175P0C221 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC175P0C221 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC175P0C221 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC175P0C221 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC175P0C221 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC175P0C221 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC175P0C221 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC175P0C221 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC175P0C221 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC175P0C221 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC175P0C221 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC175P0C221 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC175P0C221 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC175P0C221 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC175P0C221 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC175P0C221 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC175P0C221 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC175P0C221 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC175P0C221 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC175P0C221 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC175P0C221 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC175P0C221 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC175P0C221 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC175P0C221 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC175P0C221 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC175P0C221 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC175P0C221 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC175P0C221 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC175P0C221 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC175P0C221 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC175P0C221 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC175P0C221 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC175P0C221 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC175P0C221 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC175P0C221 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC175P0C221 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC175P0C221 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC175P0C221 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC175P0C221 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC175P0C221 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC175P0C221 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC175P0C221 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC175P0C221 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC175P0C221 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC175P0C221 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC175P0C221 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC175P0C221 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC175P0C221 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC175P0C221 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC175P0C221 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC175P0C221 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC175P0C221 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC175P0C221 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC175P0C221 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC175P0C221 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC175P0C221 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC175P0C221 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC175P0C221 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC175P0C221 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC175P0C221 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC175P0C221 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC175P0C221 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC175P0C221 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC175P0C221 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC175P0C221 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC175P0C221 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC175P0C221 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC175P0C221 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC175P0C221 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC175P0C221 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC175P0C221 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC175P0C221 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC175P0C221 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC175P0C221 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC175P0C221 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC175P0C221 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC175P0C221 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC175P0C221 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC175P0C221 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC175P0C221 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC175P0C221 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC175P0C221 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC175P0C221 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC175P0C221 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC175P0C221 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC175P0C221 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC175P0C221 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC175P0C221 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC175P0C221 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms