Protein–RNA interactions for Protein: P08708

RPS17, 40S ribosomal protein S17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS17P08708 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RPS17P08708 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RPS17P08708 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPS17P08708 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPS17P08708 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPS17P08708 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPS17P08708 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPS17P08708 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
RPS17P08708 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPS17P08708 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPS17P08708 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPS17P08708 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPS17P08708 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RPS17P08708 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RPS17P08708 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RPS17P08708 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RPS17P08708 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RPS17P08708 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
RPS17P08708 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
RPS17P08708 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RPS17P08708 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPS17P08708 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPS17P08708 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
RPS17P08708 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPS17P08708 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPS17P08708 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPS17P08708 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RPS17P08708 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RPS17P08708 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RPS17P08708 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RPS17P08708 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPS17P08708 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPS17P08708 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPS17P08708 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPS17P08708 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPS17P08708 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPS17P08708 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPS17P08708 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPS17P08708 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPS17P08708 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPS17P08708 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPS17P08708 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPS17P08708 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPS17P08708 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPS17P08708 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPS17P08708 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPS17P08708 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
RPS17P08708 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
RPS17P08708 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPS17P08708 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPS17P08708 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPS17P08708 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPS17P08708 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPS17P08708 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPS17P08708 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPS17P08708 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPS17P08708 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPS17P08708 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPS17P08708 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPS17P08708 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPS17P08708 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPS17P08708 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPS17P08708 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPS17P08708 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPS17P08708 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
RPS17P08708 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPS17P08708 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPS17P08708 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPS17P08708 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPS17P08708 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPS17P08708 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPS17P08708 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPS17P08708 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPS17P08708 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPS17P08708 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
RPS17P08708 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPS17P08708 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPS17P08708 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPS17P08708 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPS17P08708 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPS17P08708 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPS17P08708 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
RPS17P08708 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPS17P08708 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPS17P08708 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPS17P08708 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPS17P08708 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPS17P08708 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPS17P08708 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPS17P08708 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPS17P08708 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPS17P08708 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPS17P08708 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPS17P08708 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPS17P08708 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPS17P08708 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPS17P08708 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPS17P08708 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPS17P08708 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPS17P08708 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.8 ms