Protein–RNA interactions for Protein: P07858

CTSB, Cathepsin B, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSBP07858 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTSBP07858 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTSBP07858 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CTSBP07858 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTSBP07858 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTSBP07858 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTSBP07858 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CTSBP07858 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTSBP07858 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTSBP07858 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTSBP07858 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTSBP07858 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CTSBP07858 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTSBP07858 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTSBP07858 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTSBP07858 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTSBP07858 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTSBP07858 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTSBP07858 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTSBP07858 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTSBP07858 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTSBP07858 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTSBP07858 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTSBP07858 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CTSBP07858 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTSBP07858 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTSBP07858 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTSBP07858 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CTSBP07858 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CTSBP07858 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CTSBP07858 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTSBP07858 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTSBP07858 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTSBP07858 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTSBP07858 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTSBP07858 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTSBP07858 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTSBP07858 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTSBP07858 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTSBP07858 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTSBP07858 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTSBP07858 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTSBP07858 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTSBP07858 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTSBP07858 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTSBP07858 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTSBP07858 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTSBP07858 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTSBP07858 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTSBP07858 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTSBP07858 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTSBP07858 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTSBP07858 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTSBP07858 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTSBP07858 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTSBP07858 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTSBP07858 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTSBP07858 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTSBP07858 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTSBP07858 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CTSBP07858 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CTSBP07858 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTSBP07858 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTSBP07858 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTSBP07858 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTSBP07858 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTSBP07858 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTSBP07858 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTSBP07858 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTSBP07858 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTSBP07858 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTSBP07858 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTSBP07858 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTSBP07858 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTSBP07858 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTSBP07858 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTSBP07858 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTSBP07858 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTSBP07858 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTSBP07858 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CTSBP07858 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CTSBP07858 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTSBP07858 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTSBP07858 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CTSBP07858 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTSBP07858 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CTSBP07858 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CTSBP07858 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTSBP07858 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTSBP07858 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTSBP07858 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTSBP07858 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTSBP07858 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTSBP07858 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTSBP07858 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTSBP07858 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTSBP07858 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTSBP07858 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CTSBP07858 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTSBP07858 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 237.1 ms