Protein–RNA interactions for Protein: P07197

NEFM, Neurofilament medium polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFMP07197 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
NEFMP07197 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.88■■■□□ 2.53
NEFMP07197 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
NEFMP07197 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
NEFMP07197 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC30.87■■■□□ 2.53
NEFMP07197 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
NEFMP07197 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
NEFMP07197 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
NEFMP07197 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC30.86■■■□□ 2.53
NEFMP07197 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC30.86■■■□□ 2.53
NEFMP07197 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
NEFMP07197 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
NEFMP07197 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
NEFMP07197 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
NEFMP07197 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC30.85■■■□□ 2.53
NEFMP07197 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
NEFMP07197 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
NEFMP07197 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
NEFMP07197 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
NEFMP07197 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
NEFMP07197 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
NEFMP07197 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
NEFMP07197 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
NEFMP07197 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
NEFMP07197 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
NEFMP07197 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
NEFMP07197 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
NEFMP07197 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
NEFMP07197 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
NEFMP07197 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
NEFMP07197 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
NEFMP07197 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
NEFMP07197 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
NEFMP07197 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
NEFMP07197 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
NEFMP07197 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
NEFMP07197 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
NEFMP07197 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
NEFMP07197 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
NEFMP07197 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
NEFMP07197 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
NEFMP07197 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
NEFMP07197 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
NEFMP07197 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
NEFMP07197 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
NEFMP07197 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
NEFMP07197 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
NEFMP07197 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
NEFMP07197 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
NEFMP07197 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
NEFMP07197 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
NEFMP07197 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
NEFMP07197 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
NEFMP07197 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
NEFMP07197 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
NEFMP07197 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
NEFMP07197 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
NEFMP07197 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
NEFMP07197 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC30.79■■■□□ 2.52
NEFMP07197 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
NEFMP07197 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
NEFMP07197 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
NEFMP07197 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
NEFMP07197 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
NEFMP07197 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
NEFMP07197 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
NEFMP07197 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
NEFMP07197 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
NEFMP07197 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
NEFMP07197 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
NEFMP07197 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC30.77■■■□□ 2.52
NEFMP07197 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
NEFMP07197 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
NEFMP07197 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
NEFMP07197 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
NEFMP07197 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC30.77■■■□□ 2.52
NEFMP07197 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
NEFMP07197 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.52
NEFMP07197 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
NEFMP07197 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.52
NEFMP07197 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
NEFMP07197 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
NEFMP07197 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC30.76■■■□□ 2.51
NEFMP07197 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC30.76■■■□□ 2.51
NEFMP07197 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
NEFMP07197 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
NEFMP07197 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
NEFMP07197 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
NEFMP07197 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
NEFMP07197 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
NEFMP07197 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
NEFMP07197 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
NEFMP07197 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
NEFMP07197 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
NEFMP07197 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
NEFMP07197 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
NEFMP07197 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
NEFMP07197 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
NEFMP07197 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
NEFMP07197 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms