Protein–RNA interactions for Protein: P05386

RPLP1, 60S acidic ribosomal protein P1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPLP1P05386 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPLP1P05386 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPLP1P05386 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPLP1P05386 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPLP1P05386 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
RPLP1P05386 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPLP1P05386 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPLP1P05386 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPLP1P05386 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPLP1P05386 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPLP1P05386 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPLP1P05386 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPLP1P05386 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPLP1P05386 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPLP1P05386 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPLP1P05386 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPLP1P05386 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPLP1P05386 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
RPLP1P05386 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPLP1P05386 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPLP1P05386 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPLP1P05386 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPLP1P05386 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPLP1P05386 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPLP1P05386 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
RPLP1P05386 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPLP1P05386 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPLP1P05386 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPLP1P05386 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPLP1P05386 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPLP1P05386 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPLP1P05386 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPLP1P05386 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPLP1P05386 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPLP1P05386 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPLP1P05386 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPLP1P05386 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPLP1P05386 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPLP1P05386 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPLP1P05386 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPLP1P05386 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
RPLP1P05386 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPLP1P05386 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPLP1P05386 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPLP1P05386 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPLP1P05386 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPLP1P05386 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPLP1P05386 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPLP1P05386 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPLP1P05386 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPLP1P05386 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPLP1P05386 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
RPLP1P05386 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPLP1P05386 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPLP1P05386 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPLP1P05386 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPLP1P05386 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
RPLP1P05386 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPLP1P05386 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPLP1P05386 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPLP1P05386 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPLP1P05386 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPLP1P05386 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPLP1P05386 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPLP1P05386 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
RPLP1P05386 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPLP1P05386 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPLP1P05386 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPLP1P05386 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPLP1P05386 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPLP1P05386 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPLP1P05386 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPLP1P05386 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPLP1P05386 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPLP1P05386 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPLP1P05386 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPLP1P05386 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPLP1P05386 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
RPLP1P05386 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPLP1P05386 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPLP1P05386 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPLP1P05386 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPLP1P05386 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPLP1P05386 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPLP1P05386 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPLP1P05386 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPLP1P05386 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPLP1P05386 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
RPLP1P05386 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPLP1P05386 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPLP1P05386 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPLP1P05386 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPLP1P05386 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPLP1P05386 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPLP1P05386 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPLP1P05386 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPLP1P05386 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPLP1P05386 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPLP1P05386 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPLP1P05386 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms