Protein–RNA interactions for Protein: P04921

GYPC, Glycophorin-C, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GYPCP04921 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GYPCP04921 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GYPCP04921 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GYPCP04921 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GYPCP04921 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GYPCP04921 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GYPCP04921 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GYPCP04921 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GYPCP04921 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GYPCP04921 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GYPCP04921 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GYPCP04921 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GYPCP04921 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GYPCP04921 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GYPCP04921 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GYPCP04921 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GYPCP04921 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GYPCP04921 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GYPCP04921 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GYPCP04921 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GYPCP04921 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GYPCP04921 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GYPCP04921 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GYPCP04921 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GYPCP04921 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GYPCP04921 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GYPCP04921 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GYPCP04921 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GYPCP04921 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GYPCP04921 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GYPCP04921 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GYPCP04921 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GYPCP04921 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GYPCP04921 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GYPCP04921 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GYPCP04921 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GYPCP04921 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GYPCP04921 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
GYPCP04921 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GYPCP04921 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GYPCP04921 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GYPCP04921 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GYPCP04921 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GYPCP04921 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GYPCP04921 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GYPCP04921 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GYPCP04921 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GYPCP04921 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GYPCP04921 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GYPCP04921 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GYPCP04921 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GYPCP04921 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GYPCP04921 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GYPCP04921 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GYPCP04921 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GYPCP04921 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GYPCP04921 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GYPCP04921 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GYPCP04921 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GYPCP04921 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GYPCP04921 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GYPCP04921 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GYPCP04921 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GYPCP04921 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GYPCP04921 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GYPCP04921 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GYPCP04921 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GYPCP04921 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GYPCP04921 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GYPCP04921 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GYPCP04921 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
GYPCP04921 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GYPCP04921 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GYPCP04921 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GYPCP04921 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GYPCP04921 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GYPCP04921 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GYPCP04921 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GYPCP04921 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
GYPCP04921 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
GYPCP04921 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
GYPCP04921 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
GYPCP04921 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
GYPCP04921 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
GYPCP04921 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
GYPCP04921 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
GYPCP04921 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GYPCP04921 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GYPCP04921 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GYPCP04921 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GYPCP04921 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GYPCP04921 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GYPCP04921 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GYPCP04921 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GYPCP04921 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GYPCP04921 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GYPCP04921 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GYPCP04921 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GYPCP04921 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GYPCP04921 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms