Protein–RNA interactions for Protein: P04839

CYBB, Cytochrome b-245 heavy chain, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYBBP04839 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CYBBP04839 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CYBBP04839 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CYBBP04839 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CYBBP04839 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CYBBP04839 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CYBBP04839 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CYBBP04839 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CYBBP04839 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CYBBP04839 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CYBBP04839 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CYBBP04839 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CYBBP04839 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CYBBP04839 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CYBBP04839 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CYBBP04839 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CYBBP04839 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CYBBP04839 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CYBBP04839 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CYBBP04839 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CYBBP04839 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CYBBP04839 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CYBBP04839 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CYBBP04839 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CYBBP04839 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CYBBP04839 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CYBBP04839 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CYBBP04839 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CYBBP04839 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CYBBP04839 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CYBBP04839 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CYBBP04839 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CYBBP04839 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CYBBP04839 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CYBBP04839 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CYBBP04839 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CYBBP04839 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CYBBP04839 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CYBBP04839 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CYBBP04839 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CYBBP04839 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CYBBP04839 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CYBBP04839 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CYBBP04839 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CYBBP04839 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CYBBP04839 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CYBBP04839 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CYBBP04839 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CYBBP04839 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CYBBP04839 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CYBBP04839 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CYBBP04839 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CYBBP04839 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CYBBP04839 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CYBBP04839 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CYBBP04839 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CYBBP04839 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CYBBP04839 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CYBBP04839 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
CYBBP04839 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CYBBP04839 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CYBBP04839 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CYBBP04839 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CYBBP04839 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CYBBP04839 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CYBBP04839 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CYBBP04839 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CYBBP04839 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CYBBP04839 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CYBBP04839 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CYBBP04839 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CYBBP04839 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CYBBP04839 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CYBBP04839 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CYBBP04839 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CYBBP04839 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CYBBP04839 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CYBBP04839 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CYBBP04839 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CYBBP04839 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CYBBP04839 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CYBBP04839 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CYBBP04839 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CYBBP04839 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CYBBP04839 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CYBBP04839 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CYBBP04839 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CYBBP04839 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CYBBP04839 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CYBBP04839 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CYBBP04839 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CYBBP04839 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CYBBP04839 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CYBBP04839 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CYBBP04839 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CYBBP04839 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CYBBP04839 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CYBBP04839 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CYBBP04839 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CYBBP04839 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.6 ms