Protein–RNA interactions for Protein: P04629

NTRK1, High affinity nerve growth factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 796 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK1P04629 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NTRK1P04629 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NTRK1P04629 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NTRK1P04629 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NTRK1P04629 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NTRK1P04629 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NTRK1P04629 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NTRK1P04629 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NTRK1P04629 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NTRK1P04629 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NTRK1P04629 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NTRK1P04629 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NTRK1P04629 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
NTRK1P04629 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NTRK1P04629 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NTRK1P04629 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NTRK1P04629 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NTRK1P04629 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NTRK1P04629 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NTRK1P04629 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
NTRK1P04629 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NTRK1P04629 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NTRK1P04629 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NTRK1P04629 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NTRK1P04629 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NTRK1P04629 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NTRK1P04629 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NTRK1P04629 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NTRK1P04629 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NTRK1P04629 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NTRK1P04629 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NTRK1P04629 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NTRK1P04629 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NTRK1P04629 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NTRK1P04629 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NTRK1P04629 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NTRK1P04629 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NTRK1P04629 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NTRK1P04629 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NTRK1P04629 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NTRK1P04629 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NTRK1P04629 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NTRK1P04629 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NTRK1P04629 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NTRK1P04629 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NTRK1P04629 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NTRK1P04629 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NTRK1P04629 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NTRK1P04629 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NTRK1P04629 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NTRK1P04629 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NTRK1P04629 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NTRK1P04629 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NTRK1P04629 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NTRK1P04629 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NTRK1P04629 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NTRK1P04629 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NTRK1P04629 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NTRK1P04629 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NTRK1P04629 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NTRK1P04629 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NTRK1P04629 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NTRK1P04629 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NTRK1P04629 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NTRK1P04629 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NTRK1P04629 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NTRK1P04629 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NTRK1P04629 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NTRK1P04629 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NTRK1P04629 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NTRK1P04629 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NTRK1P04629 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NTRK1P04629 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NTRK1P04629 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
NTRK1P04629 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NTRK1P04629 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NTRK1P04629 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NTRK1P04629 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NTRK1P04629 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NTRK1P04629 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NTRK1P04629 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NTRK1P04629 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
NTRK1P04629 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NTRK1P04629 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NTRK1P04629 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NTRK1P04629 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
NTRK1P04629 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NTRK1P04629 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NTRK1P04629 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NTRK1P04629 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NTRK1P04629 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NTRK1P04629 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NTRK1P04629 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NTRK1P04629 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NTRK1P04629 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NTRK1P04629 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NTRK1P04629 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NTRK1P04629 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NTRK1P04629 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NTRK1P04629 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms