Protein–RNA interactions for Protein: P00736

C1R, Complement C1r subcomponent, humanhuman

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1RP00736 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
C1RP00736 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
C1RP00736 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
C1RP00736 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
C1RP00736 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
C1RP00736 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
C1RP00736 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
C1RP00736 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
C1RP00736 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
C1RP00736 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
C1RP00736 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
C1RP00736 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
C1RP00736 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
C1RP00736 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
C1RP00736 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
C1RP00736 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
C1RP00736 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
C1RP00736 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
C1RP00736 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
C1RP00736 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
C1RP00736 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
C1RP00736 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
C1RP00736 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
C1RP00736 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
C1RP00736 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
C1RP00736 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
C1RP00736 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
C1RP00736 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
C1RP00736 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
C1RP00736 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
C1RP00736 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
C1RP00736 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
C1RP00736 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
C1RP00736 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
C1RP00736 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
C1RP00736 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
C1RP00736 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
C1RP00736 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
C1RP00736 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
C1RP00736 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
C1RP00736 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
C1RP00736 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
C1RP00736 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
C1RP00736 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
C1RP00736 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
C1RP00736 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
C1RP00736 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
C1RP00736 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
C1RP00736 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
C1RP00736 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
C1RP00736 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
C1RP00736 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
C1RP00736 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
C1RP00736 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
C1RP00736 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
C1RP00736 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
C1RP00736 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
C1RP00736 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
C1RP00736 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
C1RP00736 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
C1RP00736 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
C1RP00736 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
C1RP00736 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
C1RP00736 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
C1RP00736 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
C1RP00736 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
C1RP00736 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
C1RP00736 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
C1RP00736 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
C1RP00736 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
C1RP00736 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
C1RP00736 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
C1RP00736 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
C1RP00736 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
C1RP00736 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
C1RP00736 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
C1RP00736 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
C1RP00736 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
C1RP00736 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
C1RP00736 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
C1RP00736 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
C1RP00736 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
C1RP00736 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
C1RP00736 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
C1RP00736 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
C1RP00736 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
C1RP00736 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
C1RP00736 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
C1RP00736 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
C1RP00736 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
C1RP00736 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
C1RP00736 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
C1RP00736 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
C1RP00736 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
C1RP00736 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
C1RP00736 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
C1RP00736 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
C1RP00736 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
C1RP00736 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
C1RP00736 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 184.4 ms