Protein–RNA interactions for Protein: O95786

DDX58, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX58, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX58O95786 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
DDX58O95786 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
DDX58O95786 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
DDX58O95786 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
DDX58O95786 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
DDX58O95786 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
DDX58O95786 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
DDX58O95786 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
DDX58O95786 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
DDX58O95786 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
DDX58O95786 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
DDX58O95786 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
DDX58O95786 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
DDX58O95786 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
DDX58O95786 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
DDX58O95786 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
DDX58O95786 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC29.48■■■□□ 2.31
DDX58O95786 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
DDX58O95786 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
DDX58O95786 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
DDX58O95786 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
DDX58O95786 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
DDX58O95786 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
DDX58O95786 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
DDX58O95786 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
DDX58O95786 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
DDX58O95786 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
DDX58O95786 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
DDX58O95786 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
DDX58O95786 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
DDX58O95786 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
DDX58O95786 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
DDX58O95786 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
DDX58O95786 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
DDX58O95786 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
DDX58O95786 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
DDX58O95786 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
DDX58O95786 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
DDX58O95786 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
DDX58O95786 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
DDX58O95786 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
DDX58O95786 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
DDX58O95786 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
DDX58O95786 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
DDX58O95786 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
DDX58O95786 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
DDX58O95786 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
DDX58O95786 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC29.42■■■□□ 2.3
DDX58O95786 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
DDX58O95786 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
DDX58O95786 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
DDX58O95786 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
DDX58O95786 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
DDX58O95786 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
DDX58O95786 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
DDX58O95786 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
DDX58O95786 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
DDX58O95786 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
DDX58O95786 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
DDX58O95786 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
DDX58O95786 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
DDX58O95786 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
DDX58O95786 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
DDX58O95786 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
DDX58O95786 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
DDX58O95786 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
DDX58O95786 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
DDX58O95786 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC29.39■■■□□ 2.3
DDX58O95786 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
DDX58O95786 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.29
DDX58O95786 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.29
DDX58O95786 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
DDX58O95786 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
DDX58O95786 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
DDX58O95786 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
DDX58O95786 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
DDX58O95786 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
DDX58O95786 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
DDX58O95786 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
DDX58O95786 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
DDX58O95786 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
DDX58O95786 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
DDX58O95786 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC29.37■■■□□ 2.29
DDX58O95786 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
DDX58O95786 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
DDX58O95786 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
DDX58O95786 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
DDX58O95786 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
DDX58O95786 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
DDX58O95786 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
DDX58O95786 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
DDX58O95786 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
DDX58O95786 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
DDX58O95786 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
DDX58O95786 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
DDX58O95786 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
DDX58O95786 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
DDX58O95786 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
DDX58O95786 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
DDX58O95786 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms