Protein–RNA interactions for Protein: O95257

GADD45G, Growth arrest and DNA damage-inducible protein GADD45 gamma, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GADD45GO95257 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GADD45GO95257 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GADD45GO95257 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GADD45GO95257 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GADD45GO95257 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GADD45GO95257 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GADD45GO95257 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GADD45GO95257 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GADD45GO95257 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GADD45GO95257 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GADD45GO95257 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GADD45GO95257 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GADD45GO95257 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GADD45GO95257 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
GADD45GO95257 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GADD45GO95257 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GADD45GO95257 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GADD45GO95257 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GADD45GO95257 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GADD45GO95257 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GADD45GO95257 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GADD45GO95257 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GADD45GO95257 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GADD45GO95257 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GADD45GO95257 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GADD45GO95257 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GADD45GO95257 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GADD45GO95257 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GADD45GO95257 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GADD45GO95257 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GADD45GO95257 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GADD45GO95257 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GADD45GO95257 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GADD45GO95257 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GADD45GO95257 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GADD45GO95257 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
GADD45GO95257 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GADD45GO95257 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GADD45GO95257 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GADD45GO95257 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GADD45GO95257 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GADD45GO95257 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GADD45GO95257 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GADD45GO95257 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GADD45GO95257 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GADD45GO95257 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GADD45GO95257 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GADD45GO95257 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GADD45GO95257 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GADD45GO95257 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GADD45GO95257 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GADD45GO95257 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GADD45GO95257 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GADD45GO95257 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GADD45GO95257 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
GADD45GO95257 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GADD45GO95257 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
GADD45GO95257 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GADD45GO95257 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GADD45GO95257 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GADD45GO95257 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GADD45GO95257 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GADD45GO95257 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GADD45GO95257 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.32■■□□□ 1
GADD45GO95257 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GADD45GO95257 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GADD45GO95257 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
GADD45GO95257 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GADD45GO95257 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GADD45GO95257 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GADD45GO95257 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GADD45GO95257 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GADD45GO95257 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GADD45GO95257 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.31■■□□□ 1
GADD45GO95257 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GADD45GO95257 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GADD45GO95257 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GADD45GO95257 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GADD45GO95257 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GADD45GO95257 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GADD45GO95257 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GADD45GO95257 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GADD45GO95257 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GADD45GO95257 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GADD45GO95257 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GADD45GO95257 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GADD45GO95257 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GADD45GO95257 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GADD45GO95257 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.29■■□□□ 1
GADD45GO95257 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GADD45GO95257 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GADD45GO95257 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GADD45GO95257 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GADD45GO95257 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GADD45GO95257 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GADD45GO95257 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
GADD45GO95257 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GADD45GO95257 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
GADD45GO95257 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
GADD45GO95257 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms