Protein–RNA interactions for Protein: O95239

KIF4A, Chromosome-associated kinesin KIF4A, humanhuman

Predictions only

Length 1,232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF4AO95239 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KIF4AO95239 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KIF4AO95239 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KIF4AO95239 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KIF4AO95239 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KIF4AO95239 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KIF4AO95239 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
KIF4AO95239 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KIF4AO95239 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
KIF4AO95239 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KIF4AO95239 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
KIF4AO95239 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KIF4AO95239 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
KIF4AO95239 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KIF4AO95239 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KIF4AO95239 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KIF4AO95239 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KIF4AO95239 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KIF4AO95239 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KIF4AO95239 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KIF4AO95239 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KIF4AO95239 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KIF4AO95239 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KIF4AO95239 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KIF4AO95239 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
KIF4AO95239 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
KIF4AO95239 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
KIF4AO95239 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KIF4AO95239 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
KIF4AO95239 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
KIF4AO95239 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KIF4AO95239 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KIF4AO95239 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KIF4AO95239 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
KIF4AO95239 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KIF4AO95239 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
KIF4AO95239 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
KIF4AO95239 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
KIF4AO95239 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
KIF4AO95239 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
KIF4AO95239 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KIF4AO95239 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
KIF4AO95239 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KIF4AO95239 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
KIF4AO95239 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
KIF4AO95239 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
KIF4AO95239 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
KIF4AO95239 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
KIF4AO95239 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
KIF4AO95239 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
KIF4AO95239 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
KIF4AO95239 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
KIF4AO95239 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
KIF4AO95239 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
KIF4AO95239 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
KIF4AO95239 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KIF4AO95239 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KIF4AO95239 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KIF4AO95239 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KIF4AO95239 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KIF4AO95239 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KIF4AO95239 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KIF4AO95239 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KIF4AO95239 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KIF4AO95239 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KIF4AO95239 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KIF4AO95239 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KIF4AO95239 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
KIF4AO95239 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KIF4AO95239 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KIF4AO95239 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KIF4AO95239 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KIF4AO95239 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KIF4AO95239 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KIF4AO95239 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KIF4AO95239 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KIF4AO95239 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KIF4AO95239 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KIF4AO95239 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KIF4AO95239 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KIF4AO95239 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KIF4AO95239 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
KIF4AO95239 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
KIF4AO95239 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KIF4AO95239 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KIF4AO95239 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KIF4AO95239 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KIF4AO95239 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KIF4AO95239 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KIF4AO95239 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KIF4AO95239 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KIF4AO95239 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KIF4AO95239 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KIF4AO95239 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KIF4AO95239 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KIF4AO95239 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KIF4AO95239 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KIF4AO95239 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KIF4AO95239 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KIF4AO95239 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms