Protein–RNA interactions for Protein: O94985

CLSTN1, Calsyntenin-1, humanhuman

Predictions only

Length 981 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN1O94985 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
CLSTN1O94985 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CLSTN1O94985 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CLSTN1O94985 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CLSTN1O94985 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CLSTN1O94985 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CLSTN1O94985 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CLSTN1O94985 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CLSTN1O94985 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CLSTN1O94985 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CLSTN1O94985 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CLSTN1O94985 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CLSTN1O94985 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CLSTN1O94985 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CLSTN1O94985 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
CLSTN1O94985 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
CLSTN1O94985 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CLSTN1O94985 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CLSTN1O94985 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CLSTN1O94985 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CLSTN1O94985 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CLSTN1O94985 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CLSTN1O94985 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CLSTN1O94985 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CLSTN1O94985 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CLSTN1O94985 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CLSTN1O94985 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CLSTN1O94985 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CLSTN1O94985 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CLSTN1O94985 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CLSTN1O94985 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLSTN1O94985 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLSTN1O94985 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLSTN1O94985 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLSTN1O94985 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLSTN1O94985 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CLSTN1O94985 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLSTN1O94985 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLSTN1O94985 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLSTN1O94985 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CLSTN1O94985 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CLSTN1O94985 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CLSTN1O94985 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CLSTN1O94985 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CLSTN1O94985 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CLSTN1O94985 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CLSTN1O94985 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CLSTN1O94985 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CLSTN1O94985 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CLSTN1O94985 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CLSTN1O94985 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CLSTN1O94985 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CLSTN1O94985 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CLSTN1O94985 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CLSTN1O94985 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CLSTN1O94985 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CLSTN1O94985 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CLSTN1O94985 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CLSTN1O94985 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CLSTN1O94985 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CLSTN1O94985 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CLSTN1O94985 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CLSTN1O94985 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CLSTN1O94985 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CLSTN1O94985 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CLSTN1O94985 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CLSTN1O94985 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CLSTN1O94985 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CLSTN1O94985 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CLSTN1O94985 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CLSTN1O94985 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CLSTN1O94985 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CLSTN1O94985 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CLSTN1O94985 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CLSTN1O94985 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CLSTN1O94985 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CLSTN1O94985 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CLSTN1O94985 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CLSTN1O94985 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CLSTN1O94985 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CLSTN1O94985 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CLSTN1O94985 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CLSTN1O94985 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CLSTN1O94985 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CLSTN1O94985 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CLSTN1O94985 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CLSTN1O94985 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CLSTN1O94985 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CLSTN1O94985 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CLSTN1O94985 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CLSTN1O94985 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CLSTN1O94985 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CLSTN1O94985 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CLSTN1O94985 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CLSTN1O94985 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CLSTN1O94985 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CLSTN1O94985 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CLSTN1O94985 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CLSTN1O94985 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CLSTN1O94985 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms