Protein–RNA interactions for Protein: O94856

NFASC, Neurofascin, humanhuman

Predictions only

Length 1,347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFASCO94856 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NFASCO94856 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NFASCO94856 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NFASCO94856 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
NFASCO94856 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NFASCO94856 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NFASCO94856 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NFASCO94856 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NFASCO94856 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NFASCO94856 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NFASCO94856 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NFASCO94856 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NFASCO94856 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NFASCO94856 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NFASCO94856 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NFASCO94856 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NFASCO94856 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NFASCO94856 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NFASCO94856 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NFASCO94856 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NFASCO94856 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NFASCO94856 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NFASCO94856 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NFASCO94856 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NFASCO94856 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NFASCO94856 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
NFASCO94856 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
NFASCO94856 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NFASCO94856 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NFASCO94856 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NFASCO94856 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NFASCO94856 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NFASCO94856 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NFASCO94856 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NFASCO94856 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
NFASCO94856 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NFASCO94856 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NFASCO94856 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NFASCO94856 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NFASCO94856 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NFASCO94856 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NFASCO94856 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NFASCO94856 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NFASCO94856 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NFASCO94856 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
NFASCO94856 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NFASCO94856 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NFASCO94856 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NFASCO94856 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NFASCO94856 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NFASCO94856 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NFASCO94856 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NFASCO94856 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NFASCO94856 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NFASCO94856 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NFASCO94856 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NFASCO94856 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NFASCO94856 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NFASCO94856 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NFASCO94856 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NFASCO94856 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NFASCO94856 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NFASCO94856 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NFASCO94856 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NFASCO94856 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NFASCO94856 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NFASCO94856 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NFASCO94856 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NFASCO94856 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NFASCO94856 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NFASCO94856 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NFASCO94856 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
NFASCO94856 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NFASCO94856 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NFASCO94856 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NFASCO94856 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NFASCO94856 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
NFASCO94856 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC26■■□□□ 1.75
NFASCO94856 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NFASCO94856 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
NFASCO94856 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NFASCO94856 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
NFASCO94856 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NFASCO94856 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NFASCO94856 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NFASCO94856 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NFASCO94856 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NFASCO94856 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NFASCO94856 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NFASCO94856 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NFASCO94856 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NFASCO94856 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NFASCO94856 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NFASCO94856 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NFASCO94856 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NFASCO94856 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NFASCO94856 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
NFASCO94856 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NFASCO94856 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NFASCO94856 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms