Protein–RNA interactions for Protein: O94769

ECM2, Extracellular matrix protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM2O94769 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ECM2O94769 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ECM2O94769 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ECM2O94769 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ECM2O94769 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ECM2O94769 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ECM2O94769 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ECM2O94769 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ECM2O94769 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ECM2O94769 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ECM2O94769 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ECM2O94769 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ECM2O94769 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ECM2O94769 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ECM2O94769 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ECM2O94769 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ECM2O94769 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ECM2O94769 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ECM2O94769 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ECM2O94769 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
ECM2O94769 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ECM2O94769 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
ECM2O94769 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ECM2O94769 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ECM2O94769 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ECM2O94769 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ECM2O94769 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ECM2O94769 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
ECM2O94769 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ECM2O94769 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
ECM2O94769 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ECM2O94769 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ECM2O94769 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ECM2O94769 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ECM2O94769 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ECM2O94769 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ECM2O94769 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ECM2O94769 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ECM2O94769 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ECM2O94769 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ECM2O94769 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ECM2O94769 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ECM2O94769 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ECM2O94769 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
ECM2O94769 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ECM2O94769 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ECM2O94769 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ECM2O94769 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ECM2O94769 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ECM2O94769 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ECM2O94769 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
ECM2O94769 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ECM2O94769 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ECM2O94769 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ECM2O94769 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ECM2O94769 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ECM2O94769 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
ECM2O94769 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
ECM2O94769 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ECM2O94769 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ECM2O94769 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ECM2O94769 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
ECM2O94769 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
ECM2O94769 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ECM2O94769 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ECM2O94769 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ECM2O94769 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ECM2O94769 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
ECM2O94769 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ECM2O94769 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ECM2O94769 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ECM2O94769 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ECM2O94769 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ECM2O94769 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
ECM2O94769 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ECM2O94769 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ECM2O94769 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ECM2O94769 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ECM2O94769 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ECM2O94769 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ECM2O94769 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ECM2O94769 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ECM2O94769 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
ECM2O94769 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ECM2O94769 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ECM2O94769 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ECM2O94769 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ECM2O94769 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ECM2O94769 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ECM2O94769 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ECM2O94769 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ECM2O94769 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ECM2O94769 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ECM2O94769 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
ECM2O94769 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
ECM2O94769 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ECM2O94769 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ECM2O94769 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
ECM2O94769 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ECM2O94769 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms