Protein–RNA interactions for Protein: O76015

KRT38, Keratin, type I cuticular Ha8, humanhuman

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT38O76015 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KRT38O76015 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
KRT38O76015 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KRT38O76015 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KRT38O76015 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KRT38O76015 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KRT38O76015 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KRT38O76015 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KRT38O76015 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KRT38O76015 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KRT38O76015 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRT38O76015 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRT38O76015 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRT38O76015 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRT38O76015 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRT38O76015 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRT38O76015 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRT38O76015 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRT38O76015 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRT38O76015 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRT38O76015 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRT38O76015 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRT38O76015 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KRT38O76015 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KRT38O76015 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KRT38O76015 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KRT38O76015 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KRT38O76015 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KRT38O76015 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KRT38O76015 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KRT38O76015 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KRT38O76015 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KRT38O76015 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KRT38O76015 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KRT38O76015 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KRT38O76015 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KRT38O76015 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KRT38O76015 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KRT38O76015 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KRT38O76015 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KRT38O76015 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KRT38O76015 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KRT38O76015 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KRT38O76015 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KRT38O76015 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KRT38O76015 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KRT38O76015 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KRT38O76015 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KRT38O76015 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KRT38O76015 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
KRT38O76015 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KRT38O76015 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KRT38O76015 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KRT38O76015 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KRT38O76015 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KRT38O76015 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KRT38O76015 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KRT38O76015 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KRT38O76015 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KRT38O76015 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KRT38O76015 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KRT38O76015 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KRT38O76015 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KRT38O76015 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KRT38O76015 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KRT38O76015 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KRT38O76015 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KRT38O76015 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KRT38O76015 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KRT38O76015 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KRT38O76015 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KRT38O76015 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KRT38O76015 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KRT38O76015 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
KRT38O76015 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KRT38O76015 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KRT38O76015 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KRT38O76015 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KRT38O76015 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KRT38O76015 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KRT38O76015 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KRT38O76015 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KRT38O76015 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KRT38O76015 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KRT38O76015 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KRT38O76015 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KRT38O76015 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KRT38O76015 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KRT38O76015 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KRT38O76015 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KRT38O76015 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KRT38O76015 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KRT38O76015 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KRT38O76015 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KRT38O76015 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KRT38O76015 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KRT38O76015 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KRT38O76015 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KRT38O76015 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KRT38O76015 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.9 ms