Protein–RNA interactions for Protein: O75969

AKAP3, A-kinase anchor protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 853 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AKAP3O75969 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
AKAP3O75969 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
AKAP3O75969 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
AKAP3O75969 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
AKAP3O75969 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
AKAP3O75969 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
AKAP3O75969 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
AKAP3O75969 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
AKAP3O75969 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
AKAP3O75969 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
AKAP3O75969 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
AKAP3O75969 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
AKAP3O75969 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
AKAP3O75969 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
AKAP3O75969 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
AKAP3O75969 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
AKAP3O75969 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
AKAP3O75969 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
AKAP3O75969 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
AKAP3O75969 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
AKAP3O75969 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
AKAP3O75969 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
AKAP3O75969 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
AKAP3O75969 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
AKAP3O75969 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
AKAP3O75969 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
AKAP3O75969 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
AKAP3O75969 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
AKAP3O75969 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
AKAP3O75969 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
AKAP3O75969 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
AKAP3O75969 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
AKAP3O75969 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
AKAP3O75969 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
AKAP3O75969 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
AKAP3O75969 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
AKAP3O75969 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
AKAP3O75969 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
AKAP3O75969 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
AKAP3O75969 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
AKAP3O75969 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
AKAP3O75969 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
AKAP3O75969 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
AKAP3O75969 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
AKAP3O75969 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
AKAP3O75969 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
AKAP3O75969 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
AKAP3O75969 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
AKAP3O75969 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
AKAP3O75969 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
AKAP3O75969 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
AKAP3O75969 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
AKAP3O75969 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
AKAP3O75969 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
AKAP3O75969 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
AKAP3O75969 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
AKAP3O75969 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
AKAP3O75969 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
AKAP3O75969 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
AKAP3O75969 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
AKAP3O75969 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
AKAP3O75969 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
AKAP3O75969 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
AKAP3O75969 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
AKAP3O75969 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
AKAP3O75969 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
AKAP3O75969 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
AKAP3O75969 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
AKAP3O75969 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
AKAP3O75969 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
AKAP3O75969 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
AKAP3O75969 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
AKAP3O75969 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
AKAP3O75969 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
AKAP3O75969 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
AKAP3O75969 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
AKAP3O75969 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
AKAP3O75969 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
AKAP3O75969 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
AKAP3O75969 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
AKAP3O75969 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
AKAP3O75969 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
AKAP3O75969 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
AKAP3O75969 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
AKAP3O75969 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
AKAP3O75969 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
AKAP3O75969 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
AKAP3O75969 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
AKAP3O75969 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
AKAP3O75969 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
AKAP3O75969 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
AKAP3O75969 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
AKAP3O75969 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
AKAP3O75969 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
AKAP3O75969 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
AKAP3O75969 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
AKAP3O75969 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
AKAP3O75969 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
AKAP3O75969 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
AKAP3O75969 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.5 ms