Protein–RNA interactions for Protein: O75844

ZMPSTE24, CAAX prenyl protease 1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZMPSTE24O75844 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ZMPSTE24O75844 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ZMPSTE24O75844 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ZMPSTE24O75844 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ZMPSTE24O75844 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
ZMPSTE24O75844 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
ZMPSTE24O75844 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
ZMPSTE24O75844 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ZMPSTE24O75844 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
ZMPSTE24O75844 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ZMPSTE24O75844 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ZMPSTE24O75844 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ZMPSTE24O75844 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ZMPSTE24O75844 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ZMPSTE24O75844 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ZMPSTE24O75844 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ZMPSTE24O75844 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ZMPSTE24O75844 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ZMPSTE24O75844 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ZMPSTE24O75844 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ZMPSTE24O75844 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ZMPSTE24O75844 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
ZMPSTE24O75844 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ZMPSTE24O75844 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ZMPSTE24O75844 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ZMPSTE24O75844 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
ZMPSTE24O75844 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ZMPSTE24O75844 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ZMPSTE24O75844 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ZMPSTE24O75844 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ZMPSTE24O75844 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ZMPSTE24O75844 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ZMPSTE24O75844 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ZMPSTE24O75844 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ZMPSTE24O75844 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ZMPSTE24O75844 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ZMPSTE24O75844 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
ZMPSTE24O75844 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ZMPSTE24O75844 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ZMPSTE24O75844 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ZMPSTE24O75844 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
ZMPSTE24O75844 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ZMPSTE24O75844 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ZMPSTE24O75844 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ZMPSTE24O75844 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ZMPSTE24O75844 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ZMPSTE24O75844 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZMPSTE24O75844 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZMPSTE24O75844 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZMPSTE24O75844 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZMPSTE24O75844 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZMPSTE24O75844 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZMPSTE24O75844 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZMPSTE24O75844 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZMPSTE24O75844 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZMPSTE24O75844 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZMPSTE24O75844 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZMPSTE24O75844 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZMPSTE24O75844 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZMPSTE24O75844 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZMPSTE24O75844 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZMPSTE24O75844 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZMPSTE24O75844 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZMPSTE24O75844 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZMPSTE24O75844 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZMPSTE24O75844 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZMPSTE24O75844 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZMPSTE24O75844 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZMPSTE24O75844 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZMPSTE24O75844 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
ZMPSTE24O75844 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
ZMPSTE24O75844 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZMPSTE24O75844 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZMPSTE24O75844 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZMPSTE24O75844 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZMPSTE24O75844 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZMPSTE24O75844 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZMPSTE24O75844 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZMPSTE24O75844 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZMPSTE24O75844 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZMPSTE24O75844 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZMPSTE24O75844 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZMPSTE24O75844 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZMPSTE24O75844 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZMPSTE24O75844 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZMPSTE24O75844 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZMPSTE24O75844 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZMPSTE24O75844 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZMPSTE24O75844 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZMPSTE24O75844 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZMPSTE24O75844 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZMPSTE24O75844 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZMPSTE24O75844 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZMPSTE24O75844 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZMPSTE24O75844 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZMPSTE24O75844 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZMPSTE24O75844 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZMPSTE24O75844 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZMPSTE24O75844 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
ZMPSTE24O75844 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms