Protein–RNA interactions for Protein: O75648

TRMU, Mitochondrial tRNA-specific 2-thiouridylase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMUO75648 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
TRMUO75648 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRMUO75648 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRMUO75648 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRMUO75648 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRMUO75648 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRMUO75648 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRMUO75648 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRMUO75648 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRMUO75648 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRMUO75648 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRMUO75648 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRMUO75648 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRMUO75648 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRMUO75648 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRMUO75648 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRMUO75648 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRMUO75648 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
TRMUO75648 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRMUO75648 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRMUO75648 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRMUO75648 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRMUO75648 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRMUO75648 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRMUO75648 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRMUO75648 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRMUO75648 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRMUO75648 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRMUO75648 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRMUO75648 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRMUO75648 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRMUO75648 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRMUO75648 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRMUO75648 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRMUO75648 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
TRMUO75648 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRMUO75648 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRMUO75648 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRMUO75648 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRMUO75648 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
TRMUO75648 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRMUO75648 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRMUO75648 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRMUO75648 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRMUO75648 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRMUO75648 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
TRMUO75648 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRMUO75648 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRMUO75648 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRMUO75648 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRMUO75648 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRMUO75648 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRMUO75648 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRMUO75648 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRMUO75648 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRMUO75648 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRMUO75648 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRMUO75648 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRMUO75648 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRMUO75648 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
TRMUO75648 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
TRMUO75648 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRMUO75648 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRMUO75648 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRMUO75648 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRMUO75648 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRMUO75648 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRMUO75648 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRMUO75648 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TRMUO75648 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TRMUO75648 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TRMUO75648 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TRMUO75648 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRMUO75648 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRMUO75648 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRMUO75648 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRMUO75648 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRMUO75648 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRMUO75648 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRMUO75648 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
TRMUO75648 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRMUO75648 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRMUO75648 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRMUO75648 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
TRMUO75648 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRMUO75648 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRMUO75648 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRMUO75648 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRMUO75648 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRMUO75648 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRMUO75648 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
TRMUO75648 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRMUO75648 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRMUO75648 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRMUO75648 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRMUO75648 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRMUO75648 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
TRMUO75648 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRMUO75648 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRMUO75648 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms