Protein–RNA interactions for Protein: O75563

SKAP2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP2O75563 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SKAP2O75563 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SKAP2O75563 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SKAP2O75563 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SKAP2O75563 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SKAP2O75563 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SKAP2O75563 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SKAP2O75563 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SKAP2O75563 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SKAP2O75563 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SKAP2O75563 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SKAP2O75563 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SKAP2O75563 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SKAP2O75563 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SKAP2O75563 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SKAP2O75563 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SKAP2O75563 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SKAP2O75563 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SKAP2O75563 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SKAP2O75563 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SKAP2O75563 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SKAP2O75563 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SKAP2O75563 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SKAP2O75563 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SKAP2O75563 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SKAP2O75563 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SKAP2O75563 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SKAP2O75563 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SKAP2O75563 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SKAP2O75563 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SKAP2O75563 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SKAP2O75563 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SKAP2O75563 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SKAP2O75563 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SKAP2O75563 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SKAP2O75563 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SKAP2O75563 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SKAP2O75563 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SKAP2O75563 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SKAP2O75563 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SKAP2O75563 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SKAP2O75563 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SKAP2O75563 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SKAP2O75563 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SKAP2O75563 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SKAP2O75563 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SKAP2O75563 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SKAP2O75563 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SKAP2O75563 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SKAP2O75563 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SKAP2O75563 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SKAP2O75563 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SKAP2O75563 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SKAP2O75563 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SKAP2O75563 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SKAP2O75563 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SKAP2O75563 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SKAP2O75563 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SKAP2O75563 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SKAP2O75563 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SKAP2O75563 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SKAP2O75563 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SKAP2O75563 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SKAP2O75563 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SKAP2O75563 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SKAP2O75563 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SKAP2O75563 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SKAP2O75563 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SKAP2O75563 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SKAP2O75563 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SKAP2O75563 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SKAP2O75563 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SKAP2O75563 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SKAP2O75563 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SKAP2O75563 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SKAP2O75563 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SKAP2O75563 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SKAP2O75563 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SKAP2O75563 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SKAP2O75563 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SKAP2O75563 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SKAP2O75563 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SKAP2O75563 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SKAP2O75563 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SKAP2O75563 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SKAP2O75563 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SKAP2O75563 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SKAP2O75563 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SKAP2O75563 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SKAP2O75563 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SKAP2O75563 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SKAP2O75563 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SKAP2O75563 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SKAP2O75563 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SKAP2O75563 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SKAP2O75563 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SKAP2O75563 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SKAP2O75563 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SKAP2O75563 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SKAP2O75563 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms