Protein–RNA interactions for Protein: O75346

ZNF253, Zinc finger protein 253, humanhuman

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF253O75346 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF253O75346 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF253O75346 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF253O75346 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF253O75346 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF253O75346 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNF253O75346 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNF253O75346 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNF253O75346 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNF253O75346 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNF253O75346 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNF253O75346 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNF253O75346 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNF253O75346 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNF253O75346 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNF253O75346 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNF253O75346 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNF253O75346 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNF253O75346 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNF253O75346 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNF253O75346 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNF253O75346 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNF253O75346 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNF253O75346 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNF253O75346 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNF253O75346 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNF253O75346 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNF253O75346 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNF253O75346 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNF253O75346 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNF253O75346 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNF253O75346 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZNF253O75346 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZNF253O75346 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZNF253O75346 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZNF253O75346 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZNF253O75346 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZNF253O75346 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZNF253O75346 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZNF253O75346 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZNF253O75346 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZNF253O75346 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZNF253O75346 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZNF253O75346 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZNF253O75346 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZNF253O75346 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZNF253O75346 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZNF253O75346 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZNF253O75346 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZNF253O75346 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZNF253O75346 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZNF253O75346 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZNF253O75346 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZNF253O75346 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZNF253O75346 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZNF253O75346 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZNF253O75346 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZNF253O75346 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZNF253O75346 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZNF253O75346 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZNF253O75346 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZNF253O75346 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZNF253O75346 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
ZNF253O75346 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZNF253O75346 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZNF253O75346 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZNF253O75346 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZNF253O75346 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZNF253O75346 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZNF253O75346 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZNF253O75346 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZNF253O75346 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZNF253O75346 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZNF253O75346 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZNF253O75346 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNF253O75346 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNF253O75346 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNF253O75346 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNF253O75346 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNF253O75346 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNF253O75346 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNF253O75346 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNF253O75346 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNF253O75346 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNF253O75346 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNF253O75346 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNF253O75346 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNF253O75346 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNF253O75346 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNF253O75346 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNF253O75346 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNF253O75346 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNF253O75346 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNF253O75346 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNF253O75346 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNF253O75346 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNF253O75346 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNF253O75346 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNF253O75346 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNF253O75346 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms