Protein–RNA interactions for Protein: O60810

PRAMEF4, PRAME family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF4O60810 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRAMEF4O60810 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRAMEF4O60810 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRAMEF4O60810 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRAMEF4O60810 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRAMEF4O60810 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRAMEF4O60810 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRAMEF4O60810 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRAMEF4O60810 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRAMEF4O60810 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRAMEF4O60810 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRAMEF4O60810 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRAMEF4O60810 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRAMEF4O60810 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PRAMEF4O60810 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRAMEF4O60810 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRAMEF4O60810 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRAMEF4O60810 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRAMEF4O60810 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRAMEF4O60810 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRAMEF4O60810 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PRAMEF4O60810 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRAMEF4O60810 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRAMEF4O60810 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PRAMEF4O60810 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRAMEF4O60810 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRAMEF4O60810 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRAMEF4O60810 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRAMEF4O60810 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRAMEF4O60810 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRAMEF4O60810 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRAMEF4O60810 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRAMEF4O60810 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRAMEF4O60810 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRAMEF4O60810 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRAMEF4O60810 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRAMEF4O60810 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRAMEF4O60810 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRAMEF4O60810 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRAMEF4O60810 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRAMEF4O60810 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRAMEF4O60810 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRAMEF4O60810 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRAMEF4O60810 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRAMEF4O60810 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRAMEF4O60810 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRAMEF4O60810 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRAMEF4O60810 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRAMEF4O60810 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRAMEF4O60810 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRAMEF4O60810 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PRAMEF4O60810 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRAMEF4O60810 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRAMEF4O60810 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRAMEF4O60810 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRAMEF4O60810 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRAMEF4O60810 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRAMEF4O60810 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRAMEF4O60810 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRAMEF4O60810 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRAMEF4O60810 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRAMEF4O60810 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRAMEF4O60810 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRAMEF4O60810 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRAMEF4O60810 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRAMEF4O60810 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRAMEF4O60810 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRAMEF4O60810 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PRAMEF4O60810 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRAMEF4O60810 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRAMEF4O60810 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRAMEF4O60810 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRAMEF4O60810 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRAMEF4O60810 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PRAMEF4O60810 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRAMEF4O60810 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRAMEF4O60810 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRAMEF4O60810 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRAMEF4O60810 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRAMEF4O60810 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRAMEF4O60810 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRAMEF4O60810 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRAMEF4O60810 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRAMEF4O60810 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRAMEF4O60810 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PRAMEF4O60810 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRAMEF4O60810 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRAMEF4O60810 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRAMEF4O60810 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRAMEF4O60810 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PRAMEF4O60810 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRAMEF4O60810 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRAMEF4O60810 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRAMEF4O60810 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRAMEF4O60810 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRAMEF4O60810 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRAMEF4O60810 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRAMEF4O60810 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRAMEF4O60810 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRAMEF4O60810 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms