Protein–RNA interactions for Protein: O60383

GDF9, Growth/differentiation factor 9, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF9O60383 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
GDF9O60383 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GDF9O60383 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GDF9O60383 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GDF9O60383 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GDF9O60383 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GDF9O60383 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GDF9O60383 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GDF9O60383 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GDF9O60383 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GDF9O60383 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GDF9O60383 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GDF9O60383 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GDF9O60383 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GDF9O60383 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GDF9O60383 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GDF9O60383 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GDF9O60383 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GDF9O60383 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GDF9O60383 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GDF9O60383 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GDF9O60383 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GDF9O60383 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
GDF9O60383 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GDF9O60383 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GDF9O60383 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GDF9O60383 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GDF9O60383 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GDF9O60383 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GDF9O60383 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GDF9O60383 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GDF9O60383 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
GDF9O60383 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GDF9O60383 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GDF9O60383 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GDF9O60383 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GDF9O60383 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GDF9O60383 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GDF9O60383 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
GDF9O60383 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GDF9O60383 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GDF9O60383 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
GDF9O60383 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GDF9O60383 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GDF9O60383 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GDF9O60383 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GDF9O60383 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GDF9O60383 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GDF9O60383 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GDF9O60383 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GDF9O60383 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
GDF9O60383 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GDF9O60383 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GDF9O60383 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GDF9O60383 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GDF9O60383 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GDF9O60383 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GDF9O60383 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GDF9O60383 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GDF9O60383 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GDF9O60383 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GDF9O60383 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GDF9O60383 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GDF9O60383 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GDF9O60383 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GDF9O60383 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
GDF9O60383 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GDF9O60383 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GDF9O60383 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GDF9O60383 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GDF9O60383 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GDF9O60383 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GDF9O60383 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GDF9O60383 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
GDF9O60383 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GDF9O60383 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
GDF9O60383 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GDF9O60383 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GDF9O60383 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GDF9O60383 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GDF9O60383 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GDF9O60383 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GDF9O60383 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GDF9O60383 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
GDF9O60383 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GDF9O60383 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GDF9O60383 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GDF9O60383 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GDF9O60383 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GDF9O60383 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
GDF9O60383 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GDF9O60383 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GDF9O60383 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GDF9O60383 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GDF9O60383 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GDF9O60383 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GDF9O60383 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GDF9O60383 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GDF9O60383 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GDF9O60383 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms