Protein–RNA interactions for Protein: O60359

CACNG3, Voltage-dependent calcium channel gamma-3 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG3O60359 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CACNG3O60359 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CACNG3O60359 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CACNG3O60359 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CACNG3O60359 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CACNG3O60359 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CACNG3O60359 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CACNG3O60359 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CACNG3O60359 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CACNG3O60359 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CACNG3O60359 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CACNG3O60359 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CACNG3O60359 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CACNG3O60359 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CACNG3O60359 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CACNG3O60359 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CACNG3O60359 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CACNG3O60359 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CACNG3O60359 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CACNG3O60359 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CACNG3O60359 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CACNG3O60359 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CACNG3O60359 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CACNG3O60359 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CACNG3O60359 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CACNG3O60359 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CACNG3O60359 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CACNG3O60359 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CACNG3O60359 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CACNG3O60359 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CACNG3O60359 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CACNG3O60359 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CACNG3O60359 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CACNG3O60359 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CACNG3O60359 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CACNG3O60359 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CACNG3O60359 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CACNG3O60359 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CACNG3O60359 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CACNG3O60359 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CACNG3O60359 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CACNG3O60359 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CACNG3O60359 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CACNG3O60359 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CACNG3O60359 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CACNG3O60359 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CACNG3O60359 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CACNG3O60359 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CACNG3O60359 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CACNG3O60359 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CACNG3O60359 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CACNG3O60359 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CACNG3O60359 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CACNG3O60359 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CACNG3O60359 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CACNG3O60359 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CACNG3O60359 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CACNG3O60359 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CACNG3O60359 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CACNG3O60359 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CACNG3O60359 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CACNG3O60359 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CACNG3O60359 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CACNG3O60359 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CACNG3O60359 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CACNG3O60359 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CACNG3O60359 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CACNG3O60359 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CACNG3O60359 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CACNG3O60359 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CACNG3O60359 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CACNG3O60359 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CACNG3O60359 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CACNG3O60359 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CACNG3O60359 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CACNG3O60359 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CACNG3O60359 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CACNG3O60359 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CACNG3O60359 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CACNG3O60359 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CACNG3O60359 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CACNG3O60359 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CACNG3O60359 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CACNG3O60359 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CACNG3O60359 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CACNG3O60359 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CACNG3O60359 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CACNG3O60359 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CACNG3O60359 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CACNG3O60359 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CACNG3O60359 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CACNG3O60359 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CACNG3O60359 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CACNG3O60359 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CACNG3O60359 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CACNG3O60359 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CACNG3O60359 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CACNG3O60359 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CACNG3O60359 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CACNG3O60359 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms