Protein–RNA interactions for Protein: O43900

PRICKLE3, Prickle planar cell polarity protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRICKLE3O43900 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PRICKLE3O43900 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PRICKLE3O43900 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRICKLE3O43900 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRICKLE3O43900 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PRICKLE3O43900 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PRICKLE3O43900 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRICKLE3O43900 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRICKLE3O43900 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRICKLE3O43900 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRICKLE3O43900 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PRICKLE3O43900 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRICKLE3O43900 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRICKLE3O43900 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRICKLE3O43900 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PRICKLE3O43900 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRICKLE3O43900 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRICKLE3O43900 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRICKLE3O43900 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRICKLE3O43900 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRICKLE3O43900 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRICKLE3O43900 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRICKLE3O43900 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRICKLE3O43900 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRICKLE3O43900 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRICKLE3O43900 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRICKLE3O43900 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRICKLE3O43900 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRICKLE3O43900 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRICKLE3O43900 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRICKLE3O43900 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRICKLE3O43900 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRICKLE3O43900 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRICKLE3O43900 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRICKLE3O43900 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRICKLE3O43900 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRICKLE3O43900 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRICKLE3O43900 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRICKLE3O43900 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRICKLE3O43900 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRICKLE3O43900 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRICKLE3O43900 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRICKLE3O43900 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRICKLE3O43900 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRICKLE3O43900 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRICKLE3O43900 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRICKLE3O43900 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRICKLE3O43900 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRICKLE3O43900 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRICKLE3O43900 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRICKLE3O43900 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRICKLE3O43900 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRICKLE3O43900 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRICKLE3O43900 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRICKLE3O43900 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRICKLE3O43900 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRICKLE3O43900 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRICKLE3O43900 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PRICKLE3O43900 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PRICKLE3O43900 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRICKLE3O43900 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRICKLE3O43900 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRICKLE3O43900 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PRICKLE3O43900 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRICKLE3O43900 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRICKLE3O43900 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRICKLE3O43900 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRICKLE3O43900 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRICKLE3O43900 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PRICKLE3O43900 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRICKLE3O43900 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRICKLE3O43900 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRICKLE3O43900 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRICKLE3O43900 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRICKLE3O43900 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRICKLE3O43900 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRICKLE3O43900 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRICKLE3O43900 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRICKLE3O43900 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRICKLE3O43900 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PRICKLE3O43900 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRICKLE3O43900 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRICKLE3O43900 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PRICKLE3O43900 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRICKLE3O43900 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRICKLE3O43900 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRICKLE3O43900 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRICKLE3O43900 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRICKLE3O43900 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRICKLE3O43900 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRICKLE3O43900 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRICKLE3O43900 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRICKLE3O43900 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRICKLE3O43900 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRICKLE3O43900 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRICKLE3O43900 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRICKLE3O43900 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRICKLE3O43900 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRICKLE3O43900 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRICKLE3O43900 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms