Protein–RNA interactions for Protein: O43791

SPOP, Speckle-type POZ protein, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOPO43791 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SPOPO43791 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SPOPO43791 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SPOPO43791 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SPOPO43791 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SPOPO43791 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SPOPO43791 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SPOPO43791 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SPOPO43791 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SPOPO43791 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SPOPO43791 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SPOPO43791 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SPOPO43791 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SPOPO43791 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SPOPO43791 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SPOPO43791 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SPOPO43791 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SPOPO43791 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SPOPO43791 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SPOPO43791 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SPOPO43791 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SPOPO43791 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SPOPO43791 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SPOPO43791 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SPOPO43791 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SPOPO43791 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SPOPO43791 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SPOPO43791 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SPOPO43791 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SPOPO43791 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPOPO43791 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPOPO43791 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPOPO43791 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPOPO43791 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPOPO43791 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPOPO43791 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPOPO43791 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SPOPO43791 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SPOPO43791 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SPOPO43791 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SPOPO43791 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SPOPO43791 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SPOPO43791 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SPOPO43791 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SPOPO43791 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SPOPO43791 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SPOPO43791 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SPOPO43791 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SPOPO43791 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SPOPO43791 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SPOPO43791 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SPOPO43791 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SPOPO43791 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SPOPO43791 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SPOPO43791 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SPOPO43791 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SPOPO43791 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SPOPO43791 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SPOPO43791 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SPOPO43791 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SPOPO43791 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SPOPO43791 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SPOPO43791 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SPOPO43791 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SPOPO43791 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SPOPO43791 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SPOPO43791 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SPOPO43791 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SPOPO43791 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SPOPO43791 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SPOPO43791 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SPOPO43791 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SPOPO43791 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SPOPO43791 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SPOPO43791 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SPOPO43791 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SPOPO43791 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SPOPO43791 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SPOPO43791 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SPOPO43791 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SPOPO43791 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SPOPO43791 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SPOPO43791 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SPOPO43791 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SPOPO43791 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SPOPO43791 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SPOPO43791 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SPOPO43791 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SPOPO43791 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SPOPO43791 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SPOPO43791 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SPOPO43791 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SPOPO43791 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SPOPO43791 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SPOPO43791 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SPOPO43791 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SPOPO43791 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SPOPO43791 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SPOPO43791 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SPOPO43791 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms