Protein–RNA interactions for Protein: O43716

GATC, Glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit C, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATCO43716 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GATCO43716 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GATCO43716 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GATCO43716 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GATCO43716 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GATCO43716 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GATCO43716 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GATCO43716 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GATCO43716 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GATCO43716 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
GATCO43716 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GATCO43716 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GATCO43716 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GATCO43716 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
GATCO43716 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GATCO43716 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GATCO43716 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GATCO43716 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GATCO43716 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GATCO43716 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GATCO43716 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GATCO43716 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GATCO43716 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GATCO43716 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GATCO43716 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GATCO43716 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GATCO43716 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GATCO43716 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC18■□□□□ 0.47
GATCO43716 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GATCO43716 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GATCO43716 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GATCO43716 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GATCO43716 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GATCO43716 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GATCO43716 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GATCO43716 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GATCO43716 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
GATCO43716 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GATCO43716 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GATCO43716 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GATCO43716 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GATCO43716 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GATCO43716 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GATCO43716 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GATCO43716 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GATCO43716 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
GATCO43716 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GATCO43716 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GATCO43716 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GATCO43716 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GATCO43716 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GATCO43716 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GATCO43716 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GATCO43716 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GATCO43716 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GATCO43716 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GATCO43716 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GATCO43716 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
GATCO43716 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GATCO43716 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GATCO43716 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GATCO43716 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GATCO43716 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GATCO43716 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GATCO43716 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GATCO43716 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GATCO43716 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GATCO43716 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GATCO43716 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GATCO43716 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GATCO43716 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GATCO43716 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GATCO43716 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GATCO43716 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
GATCO43716 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GATCO43716 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GATCO43716 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GATCO43716 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GATCO43716 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GATCO43716 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GATCO43716 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GATCO43716 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GATCO43716 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GATCO43716 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GATCO43716 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GATCO43716 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC17.96■□□□□ 0.46
GATCO43716 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GATCO43716 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GATCO43716 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GATCO43716 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GATCO43716 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GATCO43716 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GATCO43716 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GATCO43716 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GATCO43716 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GATCO43716 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GATCO43716 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GATCO43716 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
GATCO43716 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GATCO43716 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms