Protein–RNA interactions for Protein: O43711

TLX3, T-cell leukemia homeobox protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLX3O43711 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TLX3O43711 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TLX3O43711 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TLX3O43711 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TLX3O43711 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TLX3O43711 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TLX3O43711 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TLX3O43711 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TLX3O43711 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TLX3O43711 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TLX3O43711 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TLX3O43711 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TLX3O43711 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TLX3O43711 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TLX3O43711 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TLX3O43711 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TLX3O43711 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TLX3O43711 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TLX3O43711 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TLX3O43711 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TLX3O43711 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TLX3O43711 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TLX3O43711 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TLX3O43711 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TLX3O43711 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TLX3O43711 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TLX3O43711 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TLX3O43711 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TLX3O43711 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TLX3O43711 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TLX3O43711 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TLX3O43711 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TLX3O43711 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TLX3O43711 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TLX3O43711 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TLX3O43711 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TLX3O43711 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TLX3O43711 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TLX3O43711 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TLX3O43711 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TLX3O43711 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TLX3O43711 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TLX3O43711 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TLX3O43711 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TLX3O43711 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TLX3O43711 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TLX3O43711 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TLX3O43711 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TLX3O43711 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TLX3O43711 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TLX3O43711 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TLX3O43711 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TLX3O43711 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TLX3O43711 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TLX3O43711 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TLX3O43711 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TLX3O43711 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TLX3O43711 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TLX3O43711 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TLX3O43711 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TLX3O43711 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TLX3O43711 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TLX3O43711 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TLX3O43711 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TLX3O43711 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TLX3O43711 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TLX3O43711 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TLX3O43711 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TLX3O43711 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TLX3O43711 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TLX3O43711 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TLX3O43711 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TLX3O43711 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TLX3O43711 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TLX3O43711 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TLX3O43711 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TLX3O43711 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TLX3O43711 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TLX3O43711 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TLX3O43711 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TLX3O43711 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TLX3O43711 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TLX3O43711 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TLX3O43711 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TLX3O43711 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TLX3O43711 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TLX3O43711 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TLX3O43711 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TLX3O43711 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TLX3O43711 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TLX3O43711 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TLX3O43711 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TLX3O43711 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TLX3O43711 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TLX3O43711 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TLX3O43711 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TLX3O43711 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TLX3O43711 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TLX3O43711 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TLX3O43711 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms