Protein–RNA interactions for Protein: O43633

CHMP2A, Charged multivesicular body protein 2a, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP2AO43633 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CHMP2AO43633 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CHMP2AO43633 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CHMP2AO43633 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CHMP2AO43633 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CHMP2AO43633 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CHMP2AO43633 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CHMP2AO43633 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CHMP2AO43633 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CHMP2AO43633 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CHMP2AO43633 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CHMP2AO43633 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CHMP2AO43633 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CHMP2AO43633 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CHMP2AO43633 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CHMP2AO43633 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CHMP2AO43633 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CHMP2AO43633 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CHMP2AO43633 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CHMP2AO43633 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CHMP2AO43633 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CHMP2AO43633 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CHMP2AO43633 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CHMP2AO43633 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CHMP2AO43633 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
CHMP2AO43633 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CHMP2AO43633 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CHMP2AO43633 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CHMP2AO43633 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CHMP2AO43633 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CHMP2AO43633 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CHMP2AO43633 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CHMP2AO43633 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CHMP2AO43633 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
CHMP2AO43633 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CHMP2AO43633 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CHMP2AO43633 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CHMP2AO43633 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CHMP2AO43633 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CHMP2AO43633 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CHMP2AO43633 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CHMP2AO43633 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CHMP2AO43633 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CHMP2AO43633 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CHMP2AO43633 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
CHMP2AO43633 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CHMP2AO43633 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CHMP2AO43633 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CHMP2AO43633 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CHMP2AO43633 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CHMP2AO43633 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CHMP2AO43633 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CHMP2AO43633 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CHMP2AO43633 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CHMP2AO43633 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CHMP2AO43633 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CHMP2AO43633 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CHMP2AO43633 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CHMP2AO43633 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CHMP2AO43633 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
CHMP2AO43633 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CHMP2AO43633 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
CHMP2AO43633 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CHMP2AO43633 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CHMP2AO43633 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CHMP2AO43633 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CHMP2AO43633 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CHMP2AO43633 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CHMP2AO43633 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CHMP2AO43633 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CHMP2AO43633 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CHMP2AO43633 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CHMP2AO43633 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CHMP2AO43633 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CHMP2AO43633 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CHMP2AO43633 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CHMP2AO43633 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CHMP2AO43633 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CHMP2AO43633 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
CHMP2AO43633 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CHMP2AO43633 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CHMP2AO43633 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CHMP2AO43633 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CHMP2AO43633 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CHMP2AO43633 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CHMP2AO43633 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
CHMP2AO43633 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CHMP2AO43633 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CHMP2AO43633 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CHMP2AO43633 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CHMP2AO43633 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CHMP2AO43633 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CHMP2AO43633 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CHMP2AO43633 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CHMP2AO43633 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CHMP2AO43633 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CHMP2AO43633 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
CHMP2AO43633 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CHMP2AO43633 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CHMP2AO43633 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms