Protein–RNA interactions for Protein: O43555

GNRH2, Progonadoliberin-2, humanhuman

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNRH2O43555 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GNRH2O43555 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GNRH2O43555 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GNRH2O43555 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GNRH2O43555 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GNRH2O43555 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GNRH2O43555 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GNRH2O43555 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GNRH2O43555 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GNRH2O43555 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GNRH2O43555 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GNRH2O43555 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GNRH2O43555 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GNRH2O43555 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GNRH2O43555 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GNRH2O43555 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GNRH2O43555 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GNRH2O43555 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GNRH2O43555 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GNRH2O43555 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GNRH2O43555 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GNRH2O43555 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GNRH2O43555 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GNRH2O43555 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
GNRH2O43555 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
GNRH2O43555 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
GNRH2O43555 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GNRH2O43555 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GNRH2O43555 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GNRH2O43555 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GNRH2O43555 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GNRH2O43555 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GNRH2O43555 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GNRH2O43555 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GNRH2O43555 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GNRH2O43555 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GNRH2O43555 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
GNRH2O43555 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
GNRH2O43555 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GNRH2O43555 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GNRH2O43555 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GNRH2O43555 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GNRH2O43555 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GNRH2O43555 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GNRH2O43555 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GNRH2O43555 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GNRH2O43555 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GNRH2O43555 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GNRH2O43555 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GNRH2O43555 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
GNRH2O43555 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GNRH2O43555 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GNRH2O43555 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GNRH2O43555 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GNRH2O43555 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GNRH2O43555 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GNRH2O43555 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GNRH2O43555 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GNRH2O43555 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GNRH2O43555 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GNRH2O43555 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GNRH2O43555 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GNRH2O43555 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GNRH2O43555 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GNRH2O43555 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GNRH2O43555 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GNRH2O43555 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GNRH2O43555 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GNRH2O43555 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GNRH2O43555 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GNRH2O43555 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GNRH2O43555 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GNRH2O43555 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GNRH2O43555 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GNRH2O43555 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
GNRH2O43555 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GNRH2O43555 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GNRH2O43555 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GNRH2O43555 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GNRH2O43555 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GNRH2O43555 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GNRH2O43555 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GNRH2O43555 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GNRH2O43555 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GNRH2O43555 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GNRH2O43555 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GNRH2O43555 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GNRH2O43555 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
GNRH2O43555 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
GNRH2O43555 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
GNRH2O43555 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GNRH2O43555 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GNRH2O43555 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GNRH2O43555 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GNRH2O43555 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GNRH2O43555 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
GNRH2O43555 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GNRH2O43555 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GNRH2O43555 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GNRH2O43555 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms