Protein–RNA interactions for Protein: O43520

ATP8B1, Phospholipid-transporting ATPase IC, humanhuman

Predictions only

Length 1,251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP8B1O43520 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATP8B1O43520 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATP8B1O43520 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATP8B1O43520 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATP8B1O43520 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATP8B1O43520 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATP8B1O43520 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATP8B1O43520 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATP8B1O43520 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATP8B1O43520 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATP8B1O43520 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ATP8B1O43520 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ATP8B1O43520 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ATP8B1O43520 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ATP8B1O43520 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP8B1O43520 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP8B1O43520 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP8B1O43520 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP8B1O43520 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP8B1O43520 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP8B1O43520 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP8B1O43520 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP8B1O43520 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP8B1O43520 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP8B1O43520 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP8B1O43520 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP8B1O43520 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP8B1O43520 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP8B1O43520 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP8B1O43520 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP8B1O43520 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP8B1O43520 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP8B1O43520 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP8B1O43520 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP8B1O43520 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP8B1O43520 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP8B1O43520 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATP8B1O43520 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATP8B1O43520 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATP8B1O43520 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATP8B1O43520 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATP8B1O43520 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATP8B1O43520 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATP8B1O43520 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATP8B1O43520 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
ATP8B1O43520 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATP8B1O43520 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATP8B1O43520 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATP8B1O43520 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATP8B1O43520 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATP8B1O43520 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATP8B1O43520 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP8B1O43520 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP8B1O43520 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP8B1O43520 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP8B1O43520 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP8B1O43520 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP8B1O43520 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP8B1O43520 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP8B1O43520 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP8B1O43520 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP8B1O43520 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP8B1O43520 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP8B1O43520 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP8B1O43520 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP8B1O43520 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP8B1O43520 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP8B1O43520 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.43
ATP8B1O43520 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP8B1O43520 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP8B1O43520 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP8B1O43520 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP8B1O43520 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP8B1O43520 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP8B1O43520 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP8B1O43520 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP8B1O43520 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP8B1O43520 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP8B1O43520 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP8B1O43520 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ATP8B1O43520 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
ATP8B1O43520 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ATP8B1O43520 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC24■■□□□ 1.43
ATP8B1O43520 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24■■□□□ 1.43
ATP8B1O43520 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24■■□□□ 1.43
ATP8B1O43520 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ATP8B1O43520 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ATP8B1O43520 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24■■□□□ 1.43
ATP8B1O43520 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ATP8B1O43520 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATP8B1O43520 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATP8B1O43520 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATP8B1O43520 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATP8B1O43520 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATP8B1O43520 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATP8B1O43520 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATP8B1O43520 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATP8B1O43520 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATP8B1O43520 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP8B1O43520 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms