Protein–RNA interactions for Protein: O43463

SUV39H1, Histone-lysine N-methyltransferase SUV39H1, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUV39H1O43463 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SUV39H1O43463 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SUV39H1O43463 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SUV39H1O43463 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SUV39H1O43463 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SUV39H1O43463 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SUV39H1O43463 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SUV39H1O43463 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SUV39H1O43463 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SUV39H1O43463 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SUV39H1O43463 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SUV39H1O43463 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SUV39H1O43463 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SUV39H1O43463 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SUV39H1O43463 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SUV39H1O43463 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SUV39H1O43463 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SUV39H1O43463 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SUV39H1O43463 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SUV39H1O43463 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SUV39H1O43463 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SUV39H1O43463 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SUV39H1O43463 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SUV39H1O43463 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SUV39H1O43463 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SUV39H1O43463 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SUV39H1O43463 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SUV39H1O43463 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SUV39H1O43463 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SUV39H1O43463 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SUV39H1O43463 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SUV39H1O43463 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SUV39H1O43463 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SUV39H1O43463 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SUV39H1O43463 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SUV39H1O43463 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SUV39H1O43463 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SUV39H1O43463 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
SUV39H1O43463 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SUV39H1O43463 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SUV39H1O43463 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SUV39H1O43463 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SUV39H1O43463 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SUV39H1O43463 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SUV39H1O43463 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SUV39H1O43463 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SUV39H1O43463 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SUV39H1O43463 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SUV39H1O43463 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SUV39H1O43463 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SUV39H1O43463 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SUV39H1O43463 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SUV39H1O43463 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SUV39H1O43463 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SUV39H1O43463 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SUV39H1O43463 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SUV39H1O43463 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SUV39H1O43463 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SUV39H1O43463 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SUV39H1O43463 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SUV39H1O43463 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SUV39H1O43463 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SUV39H1O43463 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SUV39H1O43463 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SUV39H1O43463 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SUV39H1O43463 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SUV39H1O43463 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SUV39H1O43463 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SUV39H1O43463 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SUV39H1O43463 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SUV39H1O43463 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SUV39H1O43463 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SUV39H1O43463 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SUV39H1O43463 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SUV39H1O43463 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SUV39H1O43463 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SUV39H1O43463 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SUV39H1O43463 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SUV39H1O43463 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SUV39H1O43463 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SUV39H1O43463 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SUV39H1O43463 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SUV39H1O43463 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SUV39H1O43463 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SUV39H1O43463 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SUV39H1O43463 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SUV39H1O43463 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SUV39H1O43463 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SUV39H1O43463 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SUV39H1O43463 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SUV39H1O43463 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SUV39H1O43463 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SUV39H1O43463 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SUV39H1O43463 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SUV39H1O43463 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SUV39H1O43463 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SUV39H1O43463 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SUV39H1O43463 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SUV39H1O43463 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SUV39H1O43463 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms