Protein–RNA interactions for Protein: O43151

TET3, Methylcytosine dioxygenase TET3, humanhuman

Predictions only

Length 1,660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TET3O43151 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.07
TET3O43151 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.07
TET3O43151 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
TET3O43151 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
TET3O43151 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
TET3O43151 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC34.19■■■■□ 3.06
TET3O43151 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
TET3O43151 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
TET3O43151 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
TET3O43151 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
TET3O43151 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
TET3O43151 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
TET3O43151 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
TET3O43151 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
TET3O43151 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
TET3O43151 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
TET3O43151 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
TET3O43151 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
TET3O43151 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
TET3O43151 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC34.16■■■■□ 3.06
TET3O43151 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC34.16■■■■□ 3.06
TET3O43151 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
TET3O43151 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
TET3O43151 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
TET3O43151 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
TET3O43151 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
TET3O43151 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
TET3O43151 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
TET3O43151 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
TET3O43151 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
TET3O43151 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
TET3O43151 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
TET3O43151 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
TET3O43151 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
TET3O43151 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
TET3O43151 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
TET3O43151 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
TET3O43151 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
TET3O43151 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
TET3O43151 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.05
TET3O43151 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
TET3O43151 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC34.13■■■■□ 3.05
TET3O43151 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
TET3O43151 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
TET3O43151 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
TET3O43151 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
TET3O43151 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
TET3O43151 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC34.11■■■■□ 3.05
TET3O43151 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
TET3O43151 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
TET3O43151 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC34.11■■■■□ 3.05
TET3O43151 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
TET3O43151 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
TET3O43151 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
TET3O43151 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC34.1■■■■□ 3.05
TET3O43151 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
TET3O43151 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
TET3O43151 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
TET3O43151 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
TET3O43151 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
TET3O43151 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
TET3O43151 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC34.09■■■■□ 3.05
TET3O43151 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
TET3O43151 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC34.09■■■■□ 3.05
TET3O43151 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
TET3O43151 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
TET3O43151 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
TET3O43151 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
TET3O43151 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
TET3O43151 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC34.09■■■■□ 3.05
TET3O43151 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
TET3O43151 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
TET3O43151 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC34.08■■■■□ 3.05
TET3O43151 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
TET3O43151 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
TET3O43151 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
TET3O43151 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC34.07■■■■□ 3.04
TET3O43151 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
TET3O43151 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
TET3O43151 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC34.06■■■■□ 3.04
TET3O43151 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
TET3O43151 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
TET3O43151 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC34.06■■■■□ 3.04
TET3O43151 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
TET3O43151 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC34.05■■■■□ 3.04
TET3O43151 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
TET3O43151 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC34.05■■■■□ 3.04
TET3O43151 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC34.05■■■■□ 3.04
TET3O43151 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
TET3O43151 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
TET3O43151 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
TET3O43151 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
TET3O43151 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC34.04■■■■□ 3.04
TET3O43151 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
TET3O43151 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
TET3O43151 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
TET3O43151 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC34.03■■■■□ 3.04
TET3O43151 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC34.03■■■■□ 3.04
TET3O43151 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC34.03■■■■□ 3.04
TET3O43151 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC34.03■■■■□ 3.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.9 ms