Protein–RNA interactions for Protein: O15399

GRIN2D, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2D, humanhuman

Predictions only

Length 1,336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2DO15399 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
GRIN2DO15399 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
GRIN2DO15399 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
GRIN2DO15399 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
GRIN2DO15399 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GRIN2DO15399 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
GRIN2DO15399 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GRIN2DO15399 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
GRIN2DO15399 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
GRIN2DO15399 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
GRIN2DO15399 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GRIN2DO15399 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GRIN2DO15399 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GRIN2DO15399 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GRIN2DO15399 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GRIN2DO15399 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GRIN2DO15399 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GRIN2DO15399 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GRIN2DO15399 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GRIN2DO15399 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GRIN2DO15399 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GRIN2DO15399 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GRIN2DO15399 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GRIN2DO15399 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GRIN2DO15399 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GRIN2DO15399 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GRIN2DO15399 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GRIN2DO15399 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GRIN2DO15399 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
GRIN2DO15399 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
GRIN2DO15399 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GRIN2DO15399 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GRIN2DO15399 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GRIN2DO15399 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GRIN2DO15399 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GRIN2DO15399 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GRIN2DO15399 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GRIN2DO15399 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GRIN2DO15399 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GRIN2DO15399 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
GRIN2DO15399 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GRIN2DO15399 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GRIN2DO15399 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GRIN2DO15399 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
GRIN2DO15399 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
GRIN2DO15399 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
GRIN2DO15399 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GRIN2DO15399 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GRIN2DO15399 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GRIN2DO15399 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GRIN2DO15399 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GRIN2DO15399 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GRIN2DO15399 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GRIN2DO15399 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GRIN2DO15399 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GRIN2DO15399 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GRIN2DO15399 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GRIN2DO15399 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GRIN2DO15399 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GRIN2DO15399 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GRIN2DO15399 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GRIN2DO15399 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GRIN2DO15399 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GRIN2DO15399 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GRIN2DO15399 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GRIN2DO15399 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
GRIN2DO15399 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
GRIN2DO15399 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GRIN2DO15399 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GRIN2DO15399 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GRIN2DO15399 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GRIN2DO15399 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GRIN2DO15399 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GRIN2DO15399 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GRIN2DO15399 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GRIN2DO15399 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GRIN2DO15399 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GRIN2DO15399 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GRIN2DO15399 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GRIN2DO15399 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GRIN2DO15399 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GRIN2DO15399 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GRIN2DO15399 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GRIN2DO15399 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GRIN2DO15399 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GRIN2DO15399 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GRIN2DO15399 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GRIN2DO15399 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
GRIN2DO15399 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
GRIN2DO15399 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
GRIN2DO15399 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
GRIN2DO15399 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
GRIN2DO15399 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
GRIN2DO15399 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GRIN2DO15399 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
GRIN2DO15399 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC26■■□□□ 1.75
GRIN2DO15399 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
GRIN2DO15399 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
GRIN2DO15399 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GRIN2DO15399 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms