Protein–RNA interactions for Protein: O15160

POLR1C, DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1CO15160 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLR1CO15160 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLR1CO15160 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLR1CO15160 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
POLR1CO15160 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
POLR1CO15160 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
POLR1CO15160 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
POLR1CO15160 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
POLR1CO15160 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
POLR1CO15160 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
POLR1CO15160 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
POLR1CO15160 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
POLR1CO15160 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
POLR1CO15160 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
POLR1CO15160 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
POLR1CO15160 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
POLR1CO15160 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
POLR1CO15160 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
POLR1CO15160 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
POLR1CO15160 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
POLR1CO15160 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
POLR1CO15160 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
POLR1CO15160 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
POLR1CO15160 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
POLR1CO15160 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
POLR1CO15160 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
POLR1CO15160 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
POLR1CO15160 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLR1CO15160 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLR1CO15160 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLR1CO15160 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLR1CO15160 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLR1CO15160 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLR1CO15160 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLR1CO15160 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLR1CO15160 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLR1CO15160 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLR1CO15160 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLR1CO15160 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLR1CO15160 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
POLR1CO15160 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
POLR1CO15160 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
POLR1CO15160 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
POLR1CO15160 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
POLR1CO15160 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
POLR1CO15160 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLR1CO15160 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLR1CO15160 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLR1CO15160 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLR1CO15160 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLR1CO15160 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
POLR1CO15160 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLR1CO15160 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLR1CO15160 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLR1CO15160 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLR1CO15160 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
POLR1CO15160 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLR1CO15160 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLR1CO15160 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLR1CO15160 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLR1CO15160 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLR1CO15160 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLR1CO15160 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
POLR1CO15160 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
POLR1CO15160 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
POLR1CO15160 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
POLR1CO15160 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
POLR1CO15160 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
POLR1CO15160 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
POLR1CO15160 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
POLR1CO15160 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLR1CO15160 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLR1CO15160 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLR1CO15160 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLR1CO15160 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLR1CO15160 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLR1CO15160 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLR1CO15160 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLR1CO15160 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLR1CO15160 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLR1CO15160 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLR1CO15160 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLR1CO15160 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLR1CO15160 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
POLR1CO15160 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
POLR1CO15160 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
POLR1CO15160 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
POLR1CO15160 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
POLR1CO15160 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
POLR1CO15160 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
POLR1CO15160 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
POLR1CO15160 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
POLR1CO15160 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
POLR1CO15160 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
POLR1CO15160 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
POLR1CO15160 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
POLR1CO15160 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
POLR1CO15160 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
POLR1CO15160 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
POLR1CO15160 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms