Protein–RNA interactions for Protein: O00193

SMAP, Small acidic protein, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAPO00193 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SMAPO00193 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMAPO00193 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMAPO00193 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMAPO00193 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMAPO00193 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMAPO00193 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMAPO00193 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMAPO00193 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SMAPO00193 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMAPO00193 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMAPO00193 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMAPO00193 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMAPO00193 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMAPO00193 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMAPO00193 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMAPO00193 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMAPO00193 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMAPO00193 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SMAPO00193 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMAPO00193 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMAPO00193 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMAPO00193 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SMAPO00193 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SMAPO00193 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SMAPO00193 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SMAPO00193 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SMAPO00193 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SMAPO00193 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SMAPO00193 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SMAPO00193 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SMAPO00193 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SMAPO00193 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SMAPO00193 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SMAPO00193 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SMAPO00193 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SMAPO00193 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SMAPO00193 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SMAPO00193 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SMAPO00193 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SMAPO00193 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SMAPO00193 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SMAPO00193 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SMAPO00193 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SMAPO00193 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMAPO00193 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMAPO00193 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SMAPO00193 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMAPO00193 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMAPO00193 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMAPO00193 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMAPO00193 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMAPO00193 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMAPO00193 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMAPO00193 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMAPO00193 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMAPO00193 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMAPO00193 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMAPO00193 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMAPO00193 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SMAPO00193 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMAPO00193 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMAPO00193 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMAPO00193 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMAPO00193 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMAPO00193 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMAPO00193 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMAPO00193 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMAPO00193 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMAPO00193 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMAPO00193 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMAPO00193 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMAPO00193 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMAPO00193 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMAPO00193 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMAPO00193 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SMAPO00193 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMAPO00193 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMAPO00193 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMAPO00193 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMAPO00193 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMAPO00193 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SMAPO00193 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SMAPO00193 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SMAPO00193 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SMAPO00193 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SMAPO00193 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SMAPO00193 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SMAPO00193 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMAPO00193 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMAPO00193 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMAPO00193 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMAPO00193 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMAPO00193 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMAPO00193 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SMAPO00193 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMAPO00193 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMAPO00193 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMAPO00193 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SMAPO00193 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
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