Protein–RNA interactions for Protein: H3BNL8

C6orf229, Uncharacterized protein C6orf229, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf229H3BNL8 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
C6orf229H3BNL8 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
C6orf229H3BNL8 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
C6orf229H3BNL8 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
C6orf229H3BNL8 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
C6orf229H3BNL8 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
C6orf229H3BNL8 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
C6orf229H3BNL8 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
C6orf229H3BNL8 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
C6orf229H3BNL8 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
C6orf229H3BNL8 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
C6orf229H3BNL8 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
C6orf229H3BNL8 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
C6orf229H3BNL8 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
C6orf229H3BNL8 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
C6orf229H3BNL8 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
C6orf229H3BNL8 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
C6orf229H3BNL8 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
C6orf229H3BNL8 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
C6orf229H3BNL8 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
C6orf229H3BNL8 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
C6orf229H3BNL8 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
C6orf229H3BNL8 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
C6orf229H3BNL8 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
C6orf229H3BNL8 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
C6orf229H3BNL8 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
C6orf229H3BNL8 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.52■■■□□ 2.16
C6orf229H3BNL8 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
C6orf229H3BNL8 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC28.51■■■□□ 2.16
C6orf229H3BNL8 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
C6orf229H3BNL8 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
C6orf229H3BNL8 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
C6orf229H3BNL8 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
C6orf229H3BNL8 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
C6orf229H3BNL8 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
C6orf229H3BNL8 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
C6orf229H3BNL8 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
C6orf229H3BNL8 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
C6orf229H3BNL8 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
C6orf229H3BNL8 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
C6orf229H3BNL8 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
C6orf229H3BNL8 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
C6orf229H3BNL8 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
C6orf229H3BNL8 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
C6orf229H3BNL8 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
C6orf229H3BNL8 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
C6orf229H3BNL8 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
C6orf229H3BNL8 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
C6orf229H3BNL8 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
C6orf229H3BNL8 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
C6orf229H3BNL8 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
C6orf229H3BNL8 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
C6orf229H3BNL8 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
C6orf229H3BNL8 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
C6orf229H3BNL8 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
C6orf229H3BNL8 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
C6orf229H3BNL8 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
C6orf229H3BNL8 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
C6orf229H3BNL8 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
C6orf229H3BNL8 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
C6orf229H3BNL8 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
C6orf229H3BNL8 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
C6orf229H3BNL8 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
C6orf229H3BNL8 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
C6orf229H3BNL8 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
C6orf229H3BNL8 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
C6orf229H3BNL8 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
C6orf229H3BNL8 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
C6orf229H3BNL8 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
C6orf229H3BNL8 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
C6orf229H3BNL8 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
C6orf229H3BNL8 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
C6orf229H3BNL8 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
C6orf229H3BNL8 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
C6orf229H3BNL8 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
C6orf229H3BNL8 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
C6orf229H3BNL8 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
C6orf229H3BNL8 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
C6orf229H3BNL8 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
C6orf229H3BNL8 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
C6orf229H3BNL8 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
C6orf229H3BNL8 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
C6orf229H3BNL8 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
C6orf229H3BNL8 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
C6orf229H3BNL8 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
C6orf229H3BNL8 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
C6orf229H3BNL8 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
C6orf229H3BNL8 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
C6orf229H3BNL8 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
C6orf229H3BNL8 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
C6orf229H3BNL8 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
C6orf229H3BNL8 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
C6orf229H3BNL8 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
C6orf229H3BNL8 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
C6orf229H3BNL8 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
C6orf229H3BNL8 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
C6orf229H3BNL8 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
C6orf229H3BNL8 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
C6orf229H3BNL8 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
C6orf229H3BNL8 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms