Protein–RNA interactions for Protein: C9JE40

PATL2, Protein PAT1 homolog 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATL2C9JE40 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PATL2C9JE40 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PATL2C9JE40 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PATL2C9JE40 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PATL2C9JE40 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
PATL2C9JE40 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PATL2C9JE40 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PATL2C9JE40 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
PATL2C9JE40 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PATL2C9JE40 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
PATL2C9JE40 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PATL2C9JE40 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PATL2C9JE40 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PATL2C9JE40 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PATL2C9JE40 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PATL2C9JE40 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PATL2C9JE40 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PATL2C9JE40 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
PATL2C9JE40 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PATL2C9JE40 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PATL2C9JE40 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PATL2C9JE40 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PATL2C9JE40 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PATL2C9JE40 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PATL2C9JE40 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PATL2C9JE40 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PATL2C9JE40 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PATL2C9JE40 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PATL2C9JE40 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PATL2C9JE40 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PATL2C9JE40 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PATL2C9JE40 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PATL2C9JE40 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PATL2C9JE40 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PATL2C9JE40 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PATL2C9JE40 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PATL2C9JE40 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PATL2C9JE40 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PATL2C9JE40 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PATL2C9JE40 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PATL2C9JE40 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PATL2C9JE40 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PATL2C9JE40 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PATL2C9JE40 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PATL2C9JE40 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PATL2C9JE40 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PATL2C9JE40 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
PATL2C9JE40 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PATL2C9JE40 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PATL2C9JE40 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PATL2C9JE40 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PATL2C9JE40 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PATL2C9JE40 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PATL2C9JE40 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PATL2C9JE40 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PATL2C9JE40 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PATL2C9JE40 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PATL2C9JE40 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PATL2C9JE40 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PATL2C9JE40 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PATL2C9JE40 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PATL2C9JE40 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PATL2C9JE40 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
PATL2C9JE40 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
PATL2C9JE40 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
PATL2C9JE40 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
PATL2C9JE40 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
PATL2C9JE40 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PATL2C9JE40 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PATL2C9JE40 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PATL2C9JE40 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PATL2C9JE40 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PATL2C9JE40 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PATL2C9JE40 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PATL2C9JE40 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PATL2C9JE40 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PATL2C9JE40 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PATL2C9JE40 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PATL2C9JE40 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PATL2C9JE40 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PATL2C9JE40 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PATL2C9JE40 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PATL2C9JE40 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PATL2C9JE40 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PATL2C9JE40 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PATL2C9JE40 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PATL2C9JE40 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PATL2C9JE40 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PATL2C9JE40 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PATL2C9JE40 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PATL2C9JE40 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PATL2C9JE40 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PATL2C9JE40 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PATL2C9JE40 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PATL2C9JE40 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PATL2C9JE40 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PATL2C9JE40 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PATL2C9JE40 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
PATL2C9JE40 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PATL2C9JE40 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.9 ms