Protein–RNA interactions for Protein: C9JBD0

KRBOX1, KRAB domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRBOX1C9JBD0 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
KRBOX1C9JBD0 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
KRBOX1C9JBD0 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
KRBOX1C9JBD0 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KRBOX1C9JBD0 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KRBOX1C9JBD0 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KRBOX1C9JBD0 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KRBOX1C9JBD0 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KRBOX1C9JBD0 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KRBOX1C9JBD0 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KRBOX1C9JBD0 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.62
KRBOX1C9JBD0 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
KRBOX1C9JBD0 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
KRBOX1C9JBD0 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
KRBOX1C9JBD0 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
KRBOX1C9JBD0 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
KRBOX1C9JBD0 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
KRBOX1C9JBD0 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
KRBOX1C9JBD0 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
KRBOX1C9JBD0 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
KRBOX1C9JBD0 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KRBOX1C9JBD0 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KRBOX1C9JBD0 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KRBOX1C9JBD0 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KRBOX1C9JBD0 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KRBOX1C9JBD0 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KRBOX1C9JBD0 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KRBOX1C9JBD0 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KRBOX1C9JBD0 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KRBOX1C9JBD0 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KRBOX1C9JBD0 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KRBOX1C9JBD0 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KRBOX1C9JBD0 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KRBOX1C9JBD0 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KRBOX1C9JBD0 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KRBOX1C9JBD0 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KRBOX1C9JBD0 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KRBOX1C9JBD0 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KRBOX1C9JBD0 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KRBOX1C9JBD0 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KRBOX1C9JBD0 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KRBOX1C9JBD0 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KRBOX1C9JBD0 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KRBOX1C9JBD0 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KRBOX1C9JBD0 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KRBOX1C9JBD0 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KRBOX1C9JBD0 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KRBOX1C9JBD0 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KRBOX1C9JBD0 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KRBOX1C9JBD0 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KRBOX1C9JBD0 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KRBOX1C9JBD0 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KRBOX1C9JBD0 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KRBOX1C9JBD0 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KRBOX1C9JBD0 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KRBOX1C9JBD0 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KRBOX1C9JBD0 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KRBOX1C9JBD0 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KRBOX1C9JBD0 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KRBOX1C9JBD0 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KRBOX1C9JBD0 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KRBOX1C9JBD0 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KRBOX1C9JBD0 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
KRBOX1C9JBD0 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KRBOX1C9JBD0 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KRBOX1C9JBD0 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KRBOX1C9JBD0 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
KRBOX1C9JBD0 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
KRBOX1C9JBD0 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
KRBOX1C9JBD0 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
KRBOX1C9JBD0 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KRBOX1C9JBD0 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
KRBOX1C9JBD0 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KRBOX1C9JBD0 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
KRBOX1C9JBD0 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
KRBOX1C9JBD0 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
KRBOX1C9JBD0 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
KRBOX1C9JBD0 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
KRBOX1C9JBD0 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
KRBOX1C9JBD0 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
KRBOX1C9JBD0 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
KRBOX1C9JBD0 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
KRBOX1C9JBD0 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
KRBOX1C9JBD0 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
KRBOX1C9JBD0 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
KRBOX1C9JBD0 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
KRBOX1C9JBD0 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
KRBOX1C9JBD0 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
KRBOX1C9JBD0 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
KRBOX1C9JBD0 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
KRBOX1C9JBD0 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
KRBOX1C9JBD0 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
KRBOX1C9JBD0 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
KRBOX1C9JBD0 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
KRBOX1C9JBD0 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
KRBOX1C9JBD0 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
KRBOX1C9JBD0 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
KRBOX1C9JBD0 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
KRBOX1C9JBD0 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
KRBOX1C9JBD0 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms