Protein–RNA interactions for Protein: B3SHH9

TMEM114, Transmembrane protein 114, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM114B3SHH9 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM114B3SHH9 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM114B3SHH9 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM114B3SHH9 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM114B3SHH9 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM114B3SHH9 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM114B3SHH9 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM114B3SHH9 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM114B3SHH9 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM114B3SHH9 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM114B3SHH9 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM114B3SHH9 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM114B3SHH9 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM114B3SHH9 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM114B3SHH9 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM114B3SHH9 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM114B3SHH9 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM114B3SHH9 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM114B3SHH9 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM114B3SHH9 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM114B3SHH9 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM114B3SHH9 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM114B3SHH9 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM114B3SHH9 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM114B3SHH9 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM114B3SHH9 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM114B3SHH9 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM114B3SHH9 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM114B3SHH9 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM114B3SHH9 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM114B3SHH9 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM114B3SHH9 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM114B3SHH9 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM114B3SHH9 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM114B3SHH9 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM114B3SHH9 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM114B3SHH9 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM114B3SHH9 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM114B3SHH9 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM114B3SHH9 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM114B3SHH9 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM114B3SHH9 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM114B3SHH9 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM114B3SHH9 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM114B3SHH9 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM114B3SHH9 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM114B3SHH9 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM114B3SHH9 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM114B3SHH9 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM114B3SHH9 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM114B3SHH9 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM114B3SHH9 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM114B3SHH9 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM114B3SHH9 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM114B3SHH9 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM114B3SHH9 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM114B3SHH9 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM114B3SHH9 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM114B3SHH9 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM114B3SHH9 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM114B3SHH9 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM114B3SHH9 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM114B3SHH9 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM114B3SHH9 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM114B3SHH9 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM114B3SHH9 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM114B3SHH9 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM114B3SHH9 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM114B3SHH9 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM114B3SHH9 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM114B3SHH9 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM114B3SHH9 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM114B3SHH9 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM114B3SHH9 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM114B3SHH9 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM114B3SHH9 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM114B3SHH9 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM114B3SHH9 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM114B3SHH9 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM114B3SHH9 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM114B3SHH9 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM114B3SHH9 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM114B3SHH9 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM114B3SHH9 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM114B3SHH9 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM114B3SHH9 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM114B3SHH9 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM114B3SHH9 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM114B3SHH9 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM114B3SHH9 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM114B3SHH9 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM114B3SHH9 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM114B3SHH9 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM114B3SHH9 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM114B3SHH9 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM114B3SHH9 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM114B3SHH9 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM114B3SHH9 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM114B3SHH9 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM114B3SHH9 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms