Protein–RNA interactions for Protein: A8MU46

SMTNL1, Smoothelin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMTNL1A8MU46 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SMTNL1A8MU46 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SMTNL1A8MU46 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SMTNL1A8MU46 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SMTNL1A8MU46 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SMTNL1A8MU46 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SMTNL1A8MU46 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SMTNL1A8MU46 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SMTNL1A8MU46 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SMTNL1A8MU46 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SMTNL1A8MU46 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SMTNL1A8MU46 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SMTNL1A8MU46 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SMTNL1A8MU46 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SMTNL1A8MU46 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SMTNL1A8MU46 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SMTNL1A8MU46 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SMTNL1A8MU46 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SMTNL1A8MU46 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SMTNL1A8MU46 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SMTNL1A8MU46 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
SMTNL1A8MU46 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SMTNL1A8MU46 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SMTNL1A8MU46 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SMTNL1A8MU46 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SMTNL1A8MU46 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SMTNL1A8MU46 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SMTNL1A8MU46 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SMTNL1A8MU46 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SMTNL1A8MU46 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SMTNL1A8MU46 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SMTNL1A8MU46 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SMTNL1A8MU46 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SMTNL1A8MU46 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SMTNL1A8MU46 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SMTNL1A8MU46 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SMTNL1A8MU46 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SMTNL1A8MU46 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
SMTNL1A8MU46 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SMTNL1A8MU46 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SMTNL1A8MU46 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SMTNL1A8MU46 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SMTNL1A8MU46 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SMTNL1A8MU46 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
SMTNL1A8MU46 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SMTNL1A8MU46 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SMTNL1A8MU46 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SMTNL1A8MU46 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SMTNL1A8MU46 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SMTNL1A8MU46 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SMTNL1A8MU46 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
SMTNL1A8MU46 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SMTNL1A8MU46 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
SMTNL1A8MU46 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SMTNL1A8MU46 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SMTNL1A8MU46 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SMTNL1A8MU46 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SMTNL1A8MU46 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SMTNL1A8MU46 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SMTNL1A8MU46 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SMTNL1A8MU46 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SMTNL1A8MU46 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SMTNL1A8MU46 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SMTNL1A8MU46 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SMTNL1A8MU46 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SMTNL1A8MU46 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SMTNL1A8MU46 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SMTNL1A8MU46 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SMTNL1A8MU46 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SMTNL1A8MU46 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SMTNL1A8MU46 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SMTNL1A8MU46 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SMTNL1A8MU46 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SMTNL1A8MU46 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SMTNL1A8MU46 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SMTNL1A8MU46 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SMTNL1A8MU46 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SMTNL1A8MU46 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SMTNL1A8MU46 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SMTNL1A8MU46 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SMTNL1A8MU46 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SMTNL1A8MU46 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SMTNL1A8MU46 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SMTNL1A8MU46 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SMTNL1A8MU46 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SMTNL1A8MU46 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SMTNL1A8MU46 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SMTNL1A8MU46 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SMTNL1A8MU46 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SMTNL1A8MU46 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SMTNL1A8MU46 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SMTNL1A8MU46 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SMTNL1A8MU46 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SMTNL1A8MU46 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SMTNL1A8MU46 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SMTNL1A8MU46 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SMTNL1A8MU46 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SMTNL1A8MU46 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SMTNL1A8MU46 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SMTNL1A8MU46 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 121.4 ms