Protein–RNA interactions for Protein: A8MTQ0

NOTO, Homeobox protein notochord, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOTOA8MTQ0 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NOTOA8MTQ0 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NOTOA8MTQ0 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NOTOA8MTQ0 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NOTOA8MTQ0 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NOTOA8MTQ0 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NOTOA8MTQ0 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NOTOA8MTQ0 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NOTOA8MTQ0 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NOTOA8MTQ0 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NOTOA8MTQ0 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NOTOA8MTQ0 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NOTOA8MTQ0 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NOTOA8MTQ0 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NOTOA8MTQ0 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
NOTOA8MTQ0 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
NOTOA8MTQ0 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NOTOA8MTQ0 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NOTOA8MTQ0 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
NOTOA8MTQ0 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NOTOA8MTQ0 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NOTOA8MTQ0 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
NOTOA8MTQ0 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
NOTOA8MTQ0 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
NOTOA8MTQ0 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
NOTOA8MTQ0 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
NOTOA8MTQ0 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
NOTOA8MTQ0 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
NOTOA8MTQ0 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
NOTOA8MTQ0 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
NOTOA8MTQ0 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
NOTOA8MTQ0 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NOTOA8MTQ0 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NOTOA8MTQ0 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NOTOA8MTQ0 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NOTOA8MTQ0 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NOTOA8MTQ0 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NOTOA8MTQ0 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NOTOA8MTQ0 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NOTOA8MTQ0 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NOTOA8MTQ0 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NOTOA8MTQ0 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NOTOA8MTQ0 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NOTOA8MTQ0 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NOTOA8MTQ0 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NOTOA8MTQ0 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NOTOA8MTQ0 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NOTOA8MTQ0 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NOTOA8MTQ0 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NOTOA8MTQ0 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NOTOA8MTQ0 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NOTOA8MTQ0 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NOTOA8MTQ0 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NOTOA8MTQ0 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NOTOA8MTQ0 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NOTOA8MTQ0 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NOTOA8MTQ0 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NOTOA8MTQ0 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NOTOA8MTQ0 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NOTOA8MTQ0 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NOTOA8MTQ0 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NOTOA8MTQ0 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NOTOA8MTQ0 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NOTOA8MTQ0 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NOTOA8MTQ0 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NOTOA8MTQ0 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NOTOA8MTQ0 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NOTOA8MTQ0 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NOTOA8MTQ0 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NOTOA8MTQ0 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NOTOA8MTQ0 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NOTOA8MTQ0 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NOTOA8MTQ0 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NOTOA8MTQ0 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NOTOA8MTQ0 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NOTOA8MTQ0 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NOTOA8MTQ0 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NOTOA8MTQ0 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NOTOA8MTQ0 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NOTOA8MTQ0 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NOTOA8MTQ0 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NOTOA8MTQ0 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NOTOA8MTQ0 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NOTOA8MTQ0 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NOTOA8MTQ0 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NOTOA8MTQ0 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NOTOA8MTQ0 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
NOTOA8MTQ0 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NOTOA8MTQ0 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NOTOA8MTQ0 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NOTOA8MTQ0 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NOTOA8MTQ0 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NOTOA8MTQ0 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NOTOA8MTQ0 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NOTOA8MTQ0 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NOTOA8MTQ0 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NOTOA8MTQ0 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NOTOA8MTQ0 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NOTOA8MTQ0 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NOTOA8MTQ0 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms