Protein–RNA interactions for Protein: A8K0R7

ZNF839, Zinc finger protein 839, humanhuman

Predictions only

Length 811 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF839A8K0R7 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF839A8K0R7 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF839A8K0R7 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF839A8K0R7 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF839A8K0R7 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF839A8K0R7 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF839A8K0R7 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF839A8K0R7 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF839A8K0R7 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF839A8K0R7 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF839A8K0R7 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF839A8K0R7 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF839A8K0R7 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF839A8K0R7 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF839A8K0R7 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF839A8K0R7 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF839A8K0R7 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF839A8K0R7 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF839A8K0R7 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF839A8K0R7 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF839A8K0R7 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF839A8K0R7 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF839A8K0R7 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF839A8K0R7 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF839A8K0R7 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF839A8K0R7 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF839A8K0R7 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF839A8K0R7 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF839A8K0R7 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF839A8K0R7 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF839A8K0R7 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF839A8K0R7 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF839A8K0R7 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF839A8K0R7 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF839A8K0R7 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF839A8K0R7 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF839A8K0R7 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF839A8K0R7 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF839A8K0R7 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF839A8K0R7 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF839A8K0R7 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF839A8K0R7 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF839A8K0R7 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF839A8K0R7 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF839A8K0R7 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF839A8K0R7 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF839A8K0R7 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF839A8K0R7 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
ZNF839A8K0R7 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF839A8K0R7 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF839A8K0R7 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF839A8K0R7 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF839A8K0R7 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF839A8K0R7 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF839A8K0R7 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF839A8K0R7 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF839A8K0R7 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF839A8K0R7 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF839A8K0R7 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF839A8K0R7 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF839A8K0R7 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF839A8K0R7 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF839A8K0R7 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF839A8K0R7 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF839A8K0R7 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF839A8K0R7 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF839A8K0R7 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF839A8K0R7 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF839A8K0R7 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF839A8K0R7 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF839A8K0R7 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF839A8K0R7 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF839A8K0R7 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF839A8K0R7 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF839A8K0R7 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF839A8K0R7 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF839A8K0R7 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF839A8K0R7 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF839A8K0R7 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF839A8K0R7 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF839A8K0R7 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF839A8K0R7 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF839A8K0R7 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF839A8K0R7 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF839A8K0R7 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF839A8K0R7 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF839A8K0R7 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF839A8K0R7 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF839A8K0R7 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF839A8K0R7 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF839A8K0R7 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF839A8K0R7 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF839A8K0R7 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF839A8K0R7 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF839A8K0R7 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF839A8K0R7 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF839A8K0R7 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF839A8K0R7 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF839A8K0R7 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF839A8K0R7 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms